摘要:
基本概念 代谢物 :所有分子量小于1500Da的小分子物质,包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇、生物碱、小分子药物等等。 代谢组 :一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。 代谢组学 :利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分 阅读全文
摘要:
导入数据 BGI开发的一款web工具,用于可视化GO注释结果。自己平时不用,但要介绍给别人,简单记录下要点,避免每次授课前自己忘了又要摸索。 地址: "http://wego.genomics.org.cn/" 导入文件到灰色框中,可同时导入多个文件进行比较(点一次弹出一次)。支持多种文件格式导入, 阅读全文
摘要:
前言 pathview是一个通路可视化友好的R包,最主要的是它支持多组学数据映射(基因/蛋白 代谢)。自己用过它的R包,后来发现有网页版的,果断介绍给学员。因为不常用,记录要点,以后温习备用。 目前web版本和R包访问和应用次数如下,显然R群体用户占主导。Web界面是在PHP上使用Laravel F 阅读全文
摘要:
在文章或宣传稿中经常看到两者滥用,实际上是不同的。 首先是各个字母的含义: 16S中的"S"是一个沉降系数,亦即反映生物大分子在离心场中向下沉降速度的一个指标,值越高,说明分子越大。 rDNA 和rRNA中的小写字母"r"是ribosome(核糖体)的缩写。 rDNA指的是基因组中编码核糖体RNA( 阅读全文