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摘要: ggplot2绘图系统——图例:guide函数、标度函数、overrides.aes参数 图例调整函数 也属于标度函数,但不能单独作为对象使用,即不能如 使用。 1. guides及guides_legend函数 guide_legend函数参数: 结合 函数调整图例。 图例的四种形式: ,使用gu 阅读全文
posted @ 2020-02-14 16:02 生物信息与育种 阅读(2885) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——坐标轴调节 scale函数:图形遥控器。坐标轴标度函数: `scale_y_continous` `scale_y_discrete` 1. 连续型变量坐标轴 函数及其参数: 统计变换参数备选: 3. theme函数调节坐标轴 标度函数和theme调节坐标轴分工稍有不同,前 阅读全文
posted @ 2020-02-14 16:00 生物信息与育种 阅读(9038) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——几何对象汇总 前面介绍了常见的几种基本的几何对象,并且介绍了scale、stat等其他要素。后续将介绍position、themes、coord和faceting等函数。 这里对ggplot2几何对象进行汇总。 具体如下表: 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:59 生物信息与育种 阅读(526) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——heatmap、geom_rect 这里不介绍更常见的pheatmap包。 1.heatmap函数 基础包。 2.geom_tile ggplot2 中,热图可看作若干个小矩形组成。其几何对象就是rect(矩形)或tile(瓦片),两者效果相同。 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:57 生物信息与育种 阅读(1578) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——添加标签与文本、数学表达式、条形图文本、注释 1. 文本与标签添加 geom_label的文本将以标签形式出现,即文本会带有一个背景色。 geom_text则是纯文本形式展示。 annotaete函数则在图上添加一个注释图层。 文本与标签区别 将散点与文本组合在一起。 变量 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:56 生物信息与育种 阅读(1843) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——几何对象之线图 曲线:点连线、路径曲线、时间序列曲线、模型拟合曲线...... 直线:水平直线、垂直直线、斜线。 1.曲线 对象及其参数。 示例时间序列曲线。 点连线 需要依靠图层叠加。先画点和先画线有细微的区别,即重叠的部分后一个会覆盖前一个。 线条颜色 2.平滑曲线 参 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:55 生物信息与育种 阅读(1153) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——几何对象之盒形图 参数: 示例。 卡槽设置。 颜色设置。 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:54 生物信息与育种 阅读(715) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——几何对象之散点图 以geom开头的函数超过30个。几何对象和标度函数scale密不可分。只有在aes中传入某个变量,scale才能发挥作用。 所谓标度scale,就是图形遥控器,用于控制元素属性。相对于color/shape等参数而言,可以进行更多、更精确的设置。 颜色标度 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:52 生物信息与育种 阅读(1289) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——几何对象之直方图、密度图 1.直方图 参数。 示例。 2.概率密度曲线 三种方法: ` 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:50 生物信息与育种 阅读(915) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ggplot2绘图系统——几何对象之条图(包括误差条图) 1.条图 格式: positon: dodge并排 fill堆叠填充标准化为1 stack堆栈 identity不做调整 jitter点扰动 前四种排列方式分别如下图: 条形含义。 自定义条图颜色。 标度函数: type的三种类型与RColo 阅读全文
posted @ 2020-02-14 15:49 生物信息与育种 阅读(722) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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