摘要：
KASP的特点 在过去30 年中，分子标记从低通量限制性片段长度多态性（RFLP）开始，到最近达到的基于NGS 技术的SNP 标记，已经经历了三代。竞争性等位基因特异性PCR（kompetitive allele-specific PCR，KASP）是一种基于荧光的同质基因分型技术，最初由英国KBi 阅读全文
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问题描述 客户一个测序原始数据在百度网盘上待分析。一般思路是下载到本地，再转移到服务器。但这样相当于数据转移两次，如果客户不给你账号密码，可能还得转移三次。而百度网盘这尿性，下载会很慢很慢。 解决方案 网上查了下，百度网盘提供了一个开放的api，使用服务器的命令行即可直接下载数据。 pip inst 阅读全文
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1. SNP芯片 目前最常用的全基因组SNP分型方法，主流的SNP芯片： Illumina Infinium技术。全基因组扩增，不需PCR，采用50 mer寡核苷酸探针退火，利用特异荧光基团判定基因型。 Axiom原位光刻技术（原Affymetrix公司，后被Thermo收购）。需对DNA定量后进行 阅读全文
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目前水稻、小麦和玉米等作物GS应用主要在两个有代表性的国际组织开展，一是国际玉米小麦改良中心（CIMMYT），二是国际水稻所（IRRI），这两个都是国际农业研究协商小组（CGIAR）下属16个国际农业研究中心之一。本文（Genomic Prediction: Progress and Perspec 阅读全文
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问题描述 测序公司产出的数据到阿里云OSS，随手一个数据链接。 直接复制到本地浏览器没问题： 但在服务器用wget或curl却出现403 Forbidden： 解决 URL 里面包含特殊字符 比如 &，导致 URL 被截断，造成请求 URL 不完整，OSS 中不存在对应的文件信息，所以访问被拒绝提示 阅读全文
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一大早起来又是噩耗，PBJ也拒了，fuck。 文章被抢后，投的很艰难。 MP——>GB——>GR——>NewP——>PBJ，希望一次次破灭，现在只求快点投出去，>5就行了。 阅读全文
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基本介绍 作物智能设计育种是基于作物重要农艺性状形成的遗传和分子基础，通过人工智能决策系统设计最佳育种方案，进而定向、高效改良和培育作物新品种的一门新兴前沿交叉学科。 根据理论基础和技术手段的不同，未来智能设计育种可以分为两种范式： 一是智能化的杂交育种，根据作物目标性状的遗传结构，采用分子标记辅助 阅读全文
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开始接触这方面的东西，难啃的骨头，记录之： 可变剪接及其表观遗传调控（万字长文总结） 公众号：Epigenetics表观遗传学，有不少这方面的科普。 阅读全文
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群体遗传中的驯化起源和基因流（基因漂移）分析是顶刊杂志最关注的亮点之一，能部分解答这方面的问题，IF应该就不会低。 这里选取几篇近几年的相关研究，以借鉴用。 MP (2019) | 全球油菜种质资源全基因组测序揭示了其生态型差异的遗传基础 Whole-genome resequencing of a 阅读全文
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Science | 农科院作科所周文彬：水稻中转录因子OsDREB1C同时提高光合作用效率和氮素利用效率 A transcriptional regulator that boosts grain yields and shortens the growth duration of rice 该研究 阅读全文