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摘要: 用了这么久pheatmap包绘热图,自认为很娴熟了。但今天遇到了一件诡异的事,折腾了我一两个小时,记录备忘。 不加行注释时正常显示 pheatmap(pld, cluster_rows = F, cluster_cols = F, gaps_col = c(5,10,15,20), annotati 阅读全文
posted @ 2022-04-17 22:35 生物信息与育种 阅读(1866) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Hortic Res | 意大利巴里大学:基于不同种植地豌豆的基因型数据揭示豌豆遗传进化史 Merging genotyping-by-sequencing data from two ex situ collections provides insights on the pea evolutio 阅读全文
posted @ 2022-04-09 23:35 生物信息与育种 阅读(175) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 简介 Web Scraper是Chrome/Firefox浏览器插件,跨平台使用。 优点:使用简单,无需编程,鼠标点点就可;轻量快速爬取。 缺点:小数据量;不能爬图片;不能中止;整体较慢(网速影响可能不稳定);爬取结果乱序。 2. 基础 chrome应用商店安装插件需要fanqiang,但凡用 阅读全文
posted @ 2022-04-05 22:41 生物信息与育种 阅读(275) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要: PBJ | 西北农林:苹果优良砧木富平楸子高质量基因组,揭示楸子遗传起源及嫁接介导的抗性机理 A Chromosome-Scale Reference Genome Provides Insights into the Genetic Origin and Grafting-Mediated Str 阅读全文
posted @ 2022-04-04 12:12 生物信息与育种 阅读(174) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Science |中农华农:杨小红&严建兵&李建生:系统解析了玉米和水稻趋同选择的遗传基础 Convergent selection of a WD40 protein that enhances grain yield in maize and rice 应该是今年的爆款文章了。 揭示了穗粒数基因 阅读全文
posted @ 2022-03-27 22:35 生物信息与育种 阅读(167) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Nature Genetics | 抗条锈病小麦品种Kariega基因组组装与抗病基因Yr27挖掘 Long-read genome sequencing of bread wheat facilitates disease resistance gene cloning 沙特阿拉伯阿卜杜拉科技大学 阅读全文
posted @ 2022-03-20 22:15 生物信息与育种 阅读(298) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 报错 R version 4.0.3 $R BiocManager::install("clusterProfiler") Error in get(name, envir = asNamespace(pkg), inherits = FALSE) : object 'get_fun_from_pk 阅读全文
posted @ 2022-03-17 16:49 生物信息与育种 阅读(811) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Hortic Res | 中国医科院药植所卢善发:药用植物北马兜铃染色体水平的基因组图谱 Chromosome-level genome assembly of Aristolochia contorta provides insights into the biosynthesis of benz 阅读全文
posted @ 2022-03-13 22:41 生物信息与育种 阅读(222) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 列了几个近期植物基因编辑与农业方面的讲座,科普科普。 百博智慧大讲堂 | 基因编辑与未来农业——美国明尼苏达大学张峰 中国作物学会 | 基因编辑技术与现代农业产业应用——中国农科院谢传晓 知耕 | 打开基因编辑走向商业化的未来之门--基因编辑植物育种创新图谱深度解读 农经观察26期 | 基因组编辑技 阅读全文
posted @ 2022-03-11 23:35 生物信息与育种 阅读(88) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在对动植物杂交种(或F1子代)的基因组和转录组的关联研究中,要回答这么一个问题:基因组变异到底与基因表达有什么关系? 这个问题很难,因为涉及影响基因表达调控的因素可太多了!多少科研人员围绕着这个问题研究毕生。 但不可避免的要做等位基因特异性表达(allele-specific expression, 阅读全文
posted @ 2022-03-11 22:24 生物信息与育种 阅读(3944) 评论(2) 推荐(2) 编辑
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