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摘要: 问题 之前的conda环境好好地,最近不知为何被破坏了,运行即报错: /miniconda3/opt/lib/R/bin/exec/R: /miniconda3/opt/lib/R/bin/exec/../../lib/../../libgomp.so.1: version `GOMP_4.0' n 阅读全文
posted @ 2022-09-06 15:38 生物信息与育种 阅读(492) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: GMOD(Generic Model Organism Database) 是专为生物学家创建的开源项目,生物学家用作存储库和工具的交互应用程序和数据库的集合。 连通性是GMOD的关键。生物信息学应用程序和数据库大量产生,但其中许多工具很少使用,因为用户可能缺乏将工具连接到他们数据所需的资源或专业知 阅读全文
posted @ 2022-09-03 10:49 生物信息与育种 阅读(159) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Science Bulletin | 中国农科院作科所徐建龙&邱丽娟:大豆种质资源组学数据库SoyFGBv2.0搭建 A general model for “germplasm-omics” data sharing and mining: a case study of SoyFGB v2.0 阅读全文
posted @ 2022-08-28 15:54 生物信息与育种 阅读(338) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Hortic Res | 武汉大学李家儒:盾叶薯蓣高质量基因组解析与薯蓣皂苷生物合成进化 **The genome of Dioscorea zingiberensis sheds light on the biosynthesis, origin and evolution of the medi 阅读全文
posted @ 2022-08-28 15:52 生物信息与育种 阅读(248) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 限制智能育种的最大因素无疑仍是成本。 现代育种真的已经能动辄几百上千群体测序来进行辅助育种了吗?实际育种中恐怕芯片测序的钱都舍不得花,成本如何降低? 水稻已组装或重测序近万份骨干系材料,如何有效利用到育种?每年品比、区试积累的大量数据如何积累、规范并辅助育种? 未测序材料及后续无数后代材料,单样几十 阅读全文
posted @ 2022-08-26 15:03 生物信息与育种 阅读(71) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 从杂交基因组到杂种优势性状输出:挑战与机遇 From hybrid genomes to heterotic trait output: Challenges and opportunities. Current Opinion in Plant Biology 2022, 66:102193 北京 阅读全文
posted @ 2022-08-26 14:50 生物信息与育种 阅读(1575) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 围绕故事设计实验 统计学意义-实验重复的重要性 避免数据堆积 自己完成数据后期挖掘工作 让数据说话-寻找突破口 图形让我们更好理解数据 讨论-深入了解数据背后的故事 来自海南大学夏志强老师的建议 阅读全文
posted @ 2022-08-26 14:26 生物信息与育种 阅读(93) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: [toc] # 1.GO富集 ## 使用orgDb 通过使用Bioconductor的AnnotationHub在线检索并抓取OrgDb。 [非模式基因GO富集分析:以玉米为例+使用OrgDb](https://guangchuangyu.github.io/cn/2017/07/clusterpr 阅读全文
posted @ 2022-08-18 17:09 生物信息与育种 阅读(989) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: KASP的特点 在过去30 年中,分子标记从低通量限制性片段长度多态性(RFLP)开始,到最近达到的基于NGS 技术的SNP 标记,已经经历了三代。竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)是一种基于荧光的同质基因分型技术,最初由英国KBi 阅读全文
posted @ 2022-08-17 15:23 生物信息与育种 阅读(994) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 问题描述 客户一个测序原始数据在百度网盘上待分析。一般思路是下载到本地,再转移到服务器。但这样相当于数据转移两次,如果客户不给你账号密码,可能还得转移三次。而百度网盘这尿性,下载会很慢很慢。 解决方案 网上查了下,百度网盘提供了一个开放的api,使用服务器的命令行即可直接下载数据。 pip inst 阅读全文
posted @ 2022-08-12 17:48 生物信息与育种 阅读(3120) 评论(1) 推荐(0) 编辑
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