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摘要: 从去年年末开始到现在,大语言模型(Large Language Models,LLM)热度依旧不减。 有实力烧钱的机构在训练自己的LLM,没实力想凑热闹的更聚焦在垂直领域的应用上,绝大多数企业属于后者。 每个行业多多少都有人在做基础模型的微调和打造私有知识库,以期不被时代抛弃。 医疗、法律、金融、教 阅读全文
posted @ 2024-06-16 15:15 生物信息与育种 阅读(12) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 简介 不同划分方法: 自交和回交群体 人工和自然群体 双亲和多亲群体 遗传和育种群体 临时性和永久性群体 初级和次级群体 遗传分析中常用作图群体来构建遗传图谱或进行基因定位。作图群体是进行QTL定位的基本材料,其基本步骤如下: 首先选择在目标性状上差异较大的亲本,选择一种杂交策略构建分离群体; 记录 阅读全文
posted @ 2024-06-16 14:57 生物信息与育种 阅读(68) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 今年4月,华中农业大学焦文标团队在Genome Biology上发表论文:A comprehensive benchmark of graph‑based genetic variant genotyping algorithms on plant genomes for creating an a 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:25 生物信息与育种 阅读(7) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 作物模型提出很早,但应用有限。看起来复杂,其实解决的是环境与表型间的关联,可参考前期推文:作物生长模型CropGrow。环境组的复杂,关键在于数据的准确性获取。对于数据分析人员来说,如果不care数据准确性,分析其实很简单的,就是经典的机器学习流程。 这里提供一段伪代码仅供参考。 1. 导库 imp 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:24 生物信息与育种 阅读(19) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 近日,中国农科院植保所联合扬州大学、湖南农大等在中国工程院主刊 Engineering (一区top, IF=12.8)上发表了题为《Development of Machine Learning Methods for Accurate Prediction of Plant Disease Re 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:22 生物信息与育种 阅读(38) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本文来自CABI的一篇综述要点。文章探讨了通过选择、杂交、诱变和重组实现的新的遗传变异性,以及植物育种技术创新如何为作物改良提供更精准和更高分辨率的方法。 引言 随着全球人口的增长和气候变化带来的挑战,粮食安全成为全球关注的重点。预计到 2050 年,世界人口将达到 100 亿,这要求我们不仅要养活 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:21 生物信息与育种 阅读(8) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 分享来自张学勇老师的一篇综述。 遗传多样性是一个物种在自然界生存的基础,也是作物遗传改良的基石。经过近100年的考察、收集、评价、编目、入库,全球收集种质资源约740万份,存放在1750个种质库中;我国收集各类作物种质资源总量达50万份。丰富的资源一方面为作物改良奠定了基础,另一方面也带来了困扰,即 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:20 生物信息与育种 阅读(13) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 北京市农林科学院信息技术研究中心赵春江院士团队联合华中农业大学杨万能教授团队发布在PBJ上的综述文章:Plant microphenotype: from innovative imaging to computational analysis,深入探讨了植物微观表型(microphenotype) 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:18 生物信息与育种 阅读(7) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 分享一篇水稻种质资源创新研究与利用的相关综述,内容比较全面,包括了我国水稻种质资源收集、评价与精确鉴定、水稻新品系创制、水稻杂种优势利用、水稻种质创制新技术、新方法以及水稻优异基因资源的挖掘与利用等方面。 截止到2023 年,我国保存的作物种质资源有超过54 万份,其中有8 万多份是水稻种质资源,数 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:09 生物信息与育种 阅读(11) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具,并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。 水稻基因组数据库 水稻转录和转录后调控数据库 水稻基因网络数据库 水稻种质资源信息数据库 水稻常用的基因编辑系统 水稻基因编辑生物信息工具与数据库 水稻智能育种生物信息工具 专家简介: 阅读全文
posted @ 2024-06-16 11:07 生物信息与育种 阅读(9) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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