03 2023 档案

摘要:爱达荷大学的统计学顾问Julia Piaskowski总结的关于R包在农业研究领域应用的一个概括。 关于Julia Piaskowski:https://jpiaskowski.gitlab.io/ 来自agstats_2022_poster 更多信息: https://agstats.io/eve 阅读全文
posted @ 2023-03-30 21:21 生物信息与育种 阅读(77) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:当我对两个基因型文件位置取交集,并重新生成两个vcf: $ bcftools view -R overlap.lst variant.filter.vcf.gz -Oz -o 300.vcf.gz 出现如下错误: $ tabix 300.vcf.gz [E::hts_idx_push] Unsort 阅读全文
posted @ 2023-03-27 16:20 生物信息与育种 阅读(465) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:Xshell是我用过最好的终端访问服务器的软件,搭配Xftp文件传输,体验很好。不过6及以后版本就收费了,虽然对于学校和家庭使用可以免费,但每次都要强制升级。 Xshell6最多支持4个session。Xshell7可以无限session,但vim编辑文本时,无法通过鼠标回滚到命令行,从而无法复制命 阅读全文
posted @ 2023-03-19 10:51 生物信息与育种 阅读(1151) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:如题双击无任何反应,以管理员身份也是。 以为是版本问题,结果v6和v7都不行。 以为是win10自带防护拦截,允许应用通过防火墙,结果还是不行。 最后发现是电脑装了火绒,退出后,双击就好了。 如果你装了电脑管家、360,同样退出就好。如果你的其他应用软件也是双击无反应,同理。 参考:https:// 阅读全文
posted @ 2023-03-19 09:54 生物信息与育种 阅读(151) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1. 原版 安装比较简单。 wget https://reich.hms.harvard.edu/sites/reich.hms.harvard.edu/files/inline-files/XPCLR.tar tar xvf XPCLR.tar 直接运行bin下的XPCLR即可,若不能运行,则编译 阅读全文
posted @ 2023-03-17 21:23 生物信息与育种 阅读(883) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:原始帖 Admixture做群体结构分析是好用,但也有一些不顺手的地方。最大的问题是不支持非整数的染色体号! 相信我们手里绝大部分vcf或plink格式文件,染色体ID基本是文本类型的吧。注意plink处理时加上-allow-extra-chr,若染色体数超过人类,可使用--chr-set设置。 s 阅读全文
posted @ 2023-03-14 17:09 生物信息与育种 阅读(712) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1.打工永无出路 2.稍微大点的财富都和勤奋、学历无关 3.你及你的工作无足轻重,不要过于重视 阅读全文
posted @ 2023-03-12 22:14 生物信息与育种 阅读(92) 评论(1) 推荐(1) 编辑

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