生物信息与育种

摘要： 功能 使用BWA + GATK进行变异检测的最佳实践流程，且优化为按染色体切分，并行进行变异检测和BQSR步骤，加快分析进度。 流程图 input.json { "wgs.apply_bqsr.cpu": 32, "wgs.apply_bqsr.disks": "local-disk 250 clo 阅读全文

摘要： 功能 输入（Pair End）测序序列文件，利用fastp进行QC和质量过滤（包括质量QC统计，Adapter去除，序列trimming，过滤等），生成Clean Reads文件，以及html的报告。 input.json { "fastp.pair_end.adapter_sequence": " 阅读全文