10 2021 档案
摘要：软件的安装 Python版McScan（jcvi工具包）：https://github.com/tanghaibao/jcvi 以前只有python2，现在已有python3版本，建议用py3。安装可用pip： pip install jcvi ##或开发版 pip install git+git:
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摘要：近期又面试了两个生信工程师。 面试者A，两年工作经验，在大厂呆过，做过科服、病原感染、肿瘤检测分析，其中动植物重测序交付项目较多。非科班出身，硕士也是湿实验，自学生信，但能独立搭建流程，做一些数据挖掘，会一点机器学习，还学了C语言。和他交流下来，基础是可以的，具备多项技能。虽然现在做的方向和我们岗位
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摘要：1. 矩阵相关性计算方法 base::cor/cor.test R基础函数cor或cor.test都可计算相关性系数，但cor可直接计算矩阵的相关性，而cor.test不可。 两者计算非矩阵时，cor仅得到相关系数，而cor.test还能得到pvalue。 library(ggplot2) cor(
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摘要：主成分方差解释率计算 通常，求得了PCA降维后的特征值，我们就可以绘图，但各个维度的方差解释率没有得到，就无法获得PC坐标的百分比。 有些工具的结果是提供了维度标准差的，如ggbiplot绘图时，直接会给你算出各个坐标的方差解释率。但我觉得这类工具绘图远不如ggplot本身，此时，就需要自己计算。
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摘要：1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA，它们转录后直接在RNA 水平上就能行使各自的生物学功能，并不需要翻译成蛋白质。 2. 软件 tRNA注释 一般用tRNAscan
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