08 2021 档案
摘要：问题一：各区域注释之和大于变异总数？ snpEff的结果很简单，但常常遇到如下问题。 我的SNP总数： 但是，注释的exon、intron和intergenic之和2,278,570就已经大于了总SNP数。 我大概能知道是什么原因。一个snp会落在多个基因上，所以既有可能落在exon，又有可能落在i
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摘要：用过很多服务器，但一直没自己挂载过磁盘，因为待挂载的磁盘上都有数据，生怕一不小心把别人的弄坏了。 今天恰好有几块新的磁盘，供我尝试下。 首先查看下磁盘： $ df -h 文件系统 容量 已用 可用 已用% 挂载点 /dev/mapper/centos-root 5.4T 6.6G 5.4T 1% /
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摘要：假设我要从NCBI中下载全部水稻的mRNA序列，如何实施？ 找序列 第一步，肯定是找到相关序列。 我从ncbi taxonomy进入，搜索oryza。因为要搜索mRNA核酸序列，从此选择nucleotide，点击Go： 注意，如果你真正想要的是哪些序列。比如，稻属中可能野生稻之类的并非你想要的。这时
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摘要：近期面试了两个生信工程师。 A、B两人都是生物背景的硕士，有大厂经历，工作经验4年多。但基础都很一般，无论是编程、统计学还是专业领域知识，都比较欠缺，应该是属于那种平时重复简单工作，很少主动钻研和学习的类型。 毕竟生物信息的方向太广，他们的背景对我们这个岗位的匹配度其实并不高。但公司也很难找到一个完
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