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生物信息与育种
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2021年4月22日
使用bioawk对基因组fasta序列ID(染色体/scaffold名称)排序?
摘要: 需求 已知某基因组序列,染色体或scaffold ID顺序不定,想要对其按数字排序。 原顺序: 想要的排序结果: 实现 使用bioawk,没有的话conda直接安装。 bioawk -c fastx '{print}' old.genome.fa | \ sort -k1,1V | awk '{pr
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posted @ 2021-04-22 18:09 生物信息与育种
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