2021年4月16日
【基因组注释】同源注释比对软件tblastn、gamp和exonerate比较
摘要： 基因结构预测中同源注释策略，将mRNA、cDNA、蛋白、EST等序列比对到组装的基因组中，在文章中通常使用以下比对软件： tblastn gamp exonerate blat 根据我的实测，以上软件整体都比较慢。gmap可设置多线程来提升速度。tblastn虽然也可以，但对提速没什么影响。exon 阅读全文
posted @ 2021-04-16 12:11 生物信息与育种 阅读(2830) 评论(0) 推荐(0) 编辑