摘要：
1.原理的区别 主要区别在于，非加权组平均法（UPGMA）是基于平均链接方法的聚集层次聚类方法，而邻接法（NJ）是基于最小演化准则的迭代聚类法。 UPGMA的假定条件是：在进化过程中，每一世系发生趋异的次数相同，即核苷酸或氨基酸的替换速率是均等且恒定的。 UPGMA生成有根树，而NJ生成无根树。由于 阅读全文
摘要：
下了一些sra数据库中的公共数据，因为pretech和aspera不稳定，稍微大点的文件经常传断，部分文件我只能通过本地下载再上传。 那么问题来了，sra没有md5校验，我怎么知道我数据的完整性，尤其是通过本地下载的那些数据？ 网上查了下是说，sra是自带md5校验的（The SRA archive 阅读全文
摘要：
python写流程控制的时候，有时需要等待运行结果完成才能进行下一步。有几个想法： 一是反复循环判断直到生成结果文件（且文件中有预期结果），低效易出错； 二是用subprocess模块来判断进程结果，较为常用； 三是用drmaa包，功能强大，但使用相对复杂。 这次介绍如何用subprocess来实现 阅读全文