02 2021 档案
摘要：网上有一些很详细的教程，我这里只记录要点，其余部分按以下教程步骤来就行。 1. PicGo安装 国内下载可能较慢，取决于你的网速。下载安装好后，需要安装nodejs 和gitee插件，直接在PicGo上安装可能很慢，建议用npm在命令行安装gitee插件。 npm install picgo-plu
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摘要：1. 什么是单倍型？ 同源染色体：同源染色体，一个来自母本，一个来自于父本。 单倍型：单倍体基因型的简称。遗传学上指在单条染色体上一系列遗传变异位点的组合。 2. 单倍型组装的意义？ 目前，大多数二倍体基因组组装都忽略了同源染色体之间的差异，将基因组组装成一个假的单倍体序列，这是二倍体类型的组装的人
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摘要：前言 王向峰老师2020年发表在《Genomics Proteomics Bioinformatics》（IF=6.597）上的文章。对于做数据分析的人来说，如何挖掘公共数据，如何从海量SNP中挖掘目标SNP等问题都是每天要面对的，这篇文章给了一个参考，很值得学习。 文章从水稻变异数据库RVD的子库
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摘要：记录下下载过程，为自己和后人避坑。 1.Conda连接不上镜像源问题 首先是anaconda安装软件或创建环境时遇到的问题。即使换完清华源和其他镜像源以后依旧报错。 CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://mirrors
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摘要：前言 植物基因组大小跨越几个数量级，倍性和杂合性变化，以及新旧基因组转座子变化等带来组装挑战。三代和物理图谱提供了新机会，单倍型定相、结构变异分析、从头泛基因组研究成为新兴组装热点。 植物基因组发展： 拟南芥：sanger BAC-by-BAC。 shotgun OLC （CELERA assemb
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摘要：1. 建立项目团体 多机构合作，数据和利益共享。 2. 收集目标基因组信息 考虑的因素： 基因组大小、倍性、杂合性、GC含量和重复。 数据库查询： fungi (http://www.zbi.ee/fungalgenomesize) animals (http://www.genomesize.co
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