07 2020 档案

摘要:转录组紧紧围绕基因表达量和功能分析两部分,结合生物学问题来进行数据分析。 高表达基因已经研究比较透彻,应该更多关注中低表达基因。 层次聚类的妙用: -- 全部基因——>(差异分析)——>根据趋势挑选部分特异性基因——>功能分析; -- 功能大类聚类——>根据趋势挑选部分特异性功能——>功能小类聚类; 阅读全文
posted @ 2020-07-19 11:45 生物信息与育种 阅读(3182) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:缺失值填充在数据分析领域的预处理过程绕不过去的一个坎,蛋白质组学也不例外,简单记录下,可能有些地方有其特殊之处。 分析缺失值来源:完全随机缺失(MCAR,如质谱仪抖动,对数据影响无偏好性,均一分布),随机缺失(MAR,依赖于其他观测变量,如时间梯度越长采集越可能出现缺失值),非随机缺失(MNAR,依 阅读全文
posted @ 2020-07-18 22:17 生物信息与育种 阅读(3753) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要:1.前言 目的: 调整由于技术,如处理、上样、预分、仪器等造成的样本间误差。这实际上是一种数据缩放的方法。一般在一个表达矩阵中,会涉及到多个样本,其表达量差异比较大,不能直接进行比较。比如某个样本表达量很大,在总体中就会占据绝对领导地位,这样就会掩盖掉表达量小的样本的作用,但并不代表它不重要,也有可 阅读全文
posted @ 2020-07-17 23:41 生物信息与育种 阅读(12881) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要:肿瘤基础 特点: 疾病,无线增殖 基因相关 细胞进化过程中发展异常,突变积累 概念: germline mutation: 生殖细胞突变 somatic mutation: 体细胞突变,不可遗传 driver mutation 关键突变 passenger mutation 无关紧要 二次打击学说: 阅读全文
posted @ 2020-07-01 23:09 生物信息与育种 阅读(3745) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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