摘要:
概念 利用蛋白质组学数据,结合基因组数据(DNA)、转录组数据(RNA)来研究基因组注释问题,被称为蛋白质基因组学。“蛋白质基因组学”一词由Jaffe 等于2004 年首次提出,作者采用串联质谱数据匹配DNA翻译得到氨基酸序列的方法,在仅有810 kb 大小的细菌基因组上直接鉴定开放阅读框(open 阅读全文
摘要:
众所周知, "Proteowizard MSconvert" 用于质谱原始数据的格式转换,但主要平台是windows,要想在Linux上运行需要打Docker或Wine,对于普通用户来说还是很困难的,想想质谱的数据动辄上百Gb要进行转换相当麻烦。 比利时根特大学Dr. Lennart Martens 阅读全文
摘要:
最近读取一个数据时,报如标题的错误。 这是因为select函数对于有重复列名的数据框,选择不了。(即使不选择重复的列也会报此错误)。 可以用以下脚本查下重复的列名: 发现有两个Protein_ID的列。 如何解决呢?可改用readr读取,会智能解析。 all % dplyr::select(Prot 阅读全文
摘要:
`bash shell`脚本语法怪异,其他语言循环写入数组或列表都很简单实现,或有相应函数来做。 以下用两种方法来实现: 方法一 c=0 for i in ;do pre= filelist[$c]="$pre" ((c++)) done echo $c for i in ${filelist[@] 阅读全文
摘要:
tmux(terminal multiplexer) 是Linux上的终端复用神器。 1. 安装 (1)下载 下载及其依赖软件。 (2)安装 先安装依赖,再安装tmux。 (3)设置环境 设置环境变量。 2. 常用命令使用 tmux的结构包括 会话(session)、窗口(window)、窗格(pa 阅读全文