摘要: 记录说明 这篇文章本来是用来记录 非`root PMCMRplus R`包后,我换上了 来安装。经前人提醒,一开始安装 我是没加入环境变量的。但一直激活不了虚拟环境,所以后来我又加入了环境变量试着安装,结果这一弄还真的污染了我原有的环境,很多 包都加载和下载不了了。于是我卸了 ,重新安装 。但环境变 阅读全文
posted @ 2019-10-14 22:59 生物信息与育种 阅读(1704) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 说明 一般Linux系统自带或公共的 版本都很低,如目前我们的服务器版本的 还停留在 ,而 "官网" 已到达 版本(下载 "http://ftp.gnu.org/gnu/gcc/" ) ,有些项目编译时需要更高版本的 ,这时就需要自己额外安装一个了。 网上关于非 用户的教程有很多,但大多数都很旧且不 阅读全文
posted @ 2019-10-14 22:58 生物信息与育种 阅读(5731) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要: 前言 一般而言,我们做完pathway富集分析,就做下气泡图或bar图来进行展示,但它们实际上只考虑了富集因子和Pvalue。如果我们不关注这两个因素,而是在乎样本本身的pathway丰度呢? 对于KEGG热图绘制,大部分是做到KO层级,因为基因/蛋白和KO的绝大部分都是一对一的对应关系。如果一定要 阅读全文
posted @ 2019-10-14 16:32 生物信息与育种 阅读(3641) 评论(0) 推荐(0) 编辑