摘要：
一般我们使用pheatmap通过Rstudio交互得到的图片在plots的Export导出即可，如何保存对象到文件呢？这个需求在自动化流程中很常见，作者似乎也没说明。 生成示例数据： 看下数据亚子： 实现方法 接下来实现方法，分为两步： 1.保存对象 library(pheatmap) xx Ref 阅读全文
摘要：
字符串操作的函数（如contains），很多都包含ignore.case参数，默认是T，即不分大小写，稍不注意就会掉坑里，最好的习惯是下意识地加入这个参数。 举个例子： 我要选择An的列，就用下面这个 可以看到把转录本ID也选进去了，不检查的话后续就会出错了。所以下意识地用ignore.case参数 阅读全文
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sort grep sed awk cut paste join split 阅读全文
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一不小心投了巨多任务，或者投递的资源不合理时，想批量杀掉这些任务。 kill的方法就不说了，我这里用qdel的方法。 用了这么一条命令： qstat |sed '1,2d' |awk -F' ' '{print $1}' |sed ':x;N;s/\n/ /;b x'|cat 再用qdel删除即可。 阅读全文
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这个需求真的太常见了！注意问题强调的几个关键词：一是快速，二是大量，三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本，比如宏基因组中的物种分析： 方法一：自定义 自定义颜色：优点是选择差异明显的颜色，缺点是费时费力，不知选多少种，眼睛都要挑花。 R的颜色板很多网站都可以查，随意搜一个贴上：ht 阅读全文