2023全基因组选择实操演练学习交流会（进阶班）

目录

课程介绍

全基因组选择（Genomic selection, GS）是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法，简言之就是在全基因组范围内的标记辅助选择。全基因组选择作为新一代的育种技术，通过构建预测模型，根据全基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响着全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。相较于传统模型，非线性模型具备分析复杂非加性效应的能力，机器学习（Machine Learning，ML）和深度学习（Deep Learning，DL）算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，因此，基于机器学习算法的全基因组选择将会进一步提高选择的预测能力。

近年来，中国农业科学院作物科学研究所大数据智能设计育种创新团队在团队首席、博士生导师李慧慧研究员的带领下，联合多家单位开发出了利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法（Deep Neural Network for Genomic Prediction, DNNGP），实现了育种大数据的高效整合与利用，助力了深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供了有效工具，相关成果在线发表于《Molecular Plant》。

2023年6月初，李老师为我们举办了第一期全基因组选择学习交流会，理论学习结合系统的实操教学，解决了同学们在科研过程中的痛点、难点，得到广大学员的一致好评。为了响应大家进一步学习的意愿，也为了满足更多学员的学习需求，我们特邀李老师于12月22~25日举办第二期全基因组选择学习交流会（进阶班）。针对本期课程，李老师做了精心的策划设计，在遵循理论学习+实操演练相结合的基础上，兼顾身处不同学习阶段学员的需求，从基因组大数据的统计分析和基因型数据清洗、群体结构亲缘关系构建入手，涵盖经典统计（GBLUP，RRBLUP）和贝叶斯模型，基于机器学习算法的全基因组选择模型（SVM，KRR，RF，XGBoost，GBDT，LightGBM），基于深度学习算法的全基因组预测流程以及利用深度学习模型预测植物蛋白功能DeepGOPlus，对每个模型都做详细的预测演示和交叉验证结果评价并实现可视化，基于KNIME平台构建深度学习网络，最终让我们能够利用DNNGP方法与KNIME平台实现基于机器学习算法的全基因组预测。

为了让大家能够获得最佳学习效果，学员成功报名并交费后，即可先行获得第一期课程回放（课程内容参见我们往期会议通知）作为预习资料，包括课程所需软件（永久免费使用）及软件的安装指导视频。课时四天，干货满满，相信将为您呈现一场全基因组选择的视听盛宴。

培训形式

  • 形 式：腾讯会议线上直播（课程免费回放三个月）

  • 时 间：2023年12月22-25日

课程对象

所有从事植物、动物、林木、水产等的遗传育种、数量遗传学及相关领域研究的在读研究生、科研人员及企业研发人员。

课程收获

  • 熟练掌握基因组大数据统计分析和群体结构亲缘关系构建；
  • 系统学习经典统计GBLUP、RRBLUP和贝叶斯模型，能够独立运用经典统计模型进行全基因组预测，实施目标群体预测；
  • 系统学习基于机器学习算法的全基因组预测流程，能够独立运用SVM、KRR、RF、XGBoost、GBDT及LightGBM模型进行全基因组预测，进行交叉验证结果评价，实现预测结果的可视化，模型优化及实施目标群体预测；
  • 系统学习DNNGP软件与KNIME平台的使用方法，利用KNIME平台构建深度学习网络，实现基于机器学习算法的全基因组预测。

课程安排

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软件要求：

1）安装anaconda或miniconda

2）安装R及Rstudio软件平台

3）配置Jupyter Notebook环境

4）安装Pycharm开发平台（选择安装）

5）安装KNIME软件

注：相关软件请在报名交费后于会务人员处获取，电话15210096658（微信同号）

主讲专家

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收费标准

学时4天，3600元/人（包含3个月的视频回放）。成功报名并交费后即可获赠第一期课程回放。

优惠1：三人成团，团购价3200元/人。
优惠2：早鸟优惠，11月26日之前报名并交费尊享3300元/人。
温馨提示：两项优惠任选其一，不可叠加使用。

扫码报名

扫描或长按识别下方二维码，填写报名信息，提交并支付汇款，即为报名成功，报名截止于2023年12月21日17:00，届时报名通道将自动关闭。
扫码报名

交费方式

1. 转账汇款

收款单位：北京金智研生物科技有限公司

开户银行：中国工商银行股份有限公司北京中海凯旋支行

账号：0200205009200045825

2. 个人扫码支付

对于不能及时由单位转账的学员，可接受个人垫付的形式，我们在收到报名费后，会及时为您开具发票协助办理报销事宜。扫描下方二维码（支持公务卡、银联卡、信用卡）即可完成支付。如遇问题，请致电或微信：15210096658。

温馨提示：汇款时请备注“姓名+全基因组选择”
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注意事项

1. 会议通知
以下链接为本期培训班的《会议通知》，请自行下载保存。
全基因组选择实操演练学习交流会的通知（第二期）.pdf

2. 关于发票
请准确填写报名表单的发票信息。在此过程中，您有任何问题可以先行与我们沟通联系，我们都将为您做出详细解答，电话：15210096658（微信同号）。

联系方式

  • 电话：杨老师：15210096658；徐老师：15001277701，010-88608002
  • QQ: 3442810497
  • 网址：www.jinzhiyanbio.com

更多详情查看微信公众号：
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posted @ 2023-11-04 22:28  生物信息与育种  阅读(165)  评论(0)  编辑  收藏  举报