蛋白质组学原理与数据分析合集

最近看到微信公众号：“生物信息与育种” 的文章阅读量太低了，粉丝量基础也很少。可能是做动植物基因组和育种相关工作的人员基数相对较少，而且我也没有主动去推。于是想着把以前做的的蛋白质组学部分笔记迁移到公众号上，一是为内容备份，二是为增加粉丝和阅读量。不过这些笔记是几年前的了，可能已经跟不上前沿的发展，而我目前由于没有从事相关工作，也无法把握内容的质量，仅供参考。

蛋白质组学综合文集

蛋白质组学研究方法概述一

蛋白质组学研究方法概述二

蛋白质组学样品前处理一

蛋白质组学样品前处理二

蛋白质组学样品前处理三

蛋白质组学样品前处理四

蛋白质谱的原理及使用一

蛋白质谱的原理及使用二

蛋白质谱的原理及使用三

蛋白质谱的原理及使用四

蛋白质组学数据分析基础一

蛋白质组学数据分析基础二

蛋白质组学数据分析基础三

蛋白质组学常用软件系列

蛋白质组学鉴定软件之X!Tandem

蛋白质组学鉴定软件之Comet

蛋白质组学鉴定软件之Mascot

蛋白质组学鉴定软件之MSGF+

蛋白质组学鉴定定量软件之Proteome Discoverer(PD)

蛋白质组学鉴定定量软件之MaxQuant

蛋白组DIA分析：Spectronaut软件使用指南

DIA技术及其软件工具介绍

其他

蛋白质组学数据的归一化/标准化处理

蛋白质组学数据的缺失值填充

蛋白质组学实验设计、质控与分析

质谱仪常见参数

宏蛋白质组研究概述

宏蛋白质组搜库工具简介与评估

【ThermoRawFileParser】质谱raw格式转换mgf

【ProteoWizard MSConvert】质谱文件格式简介及其转换