生信工程师如何写一个小工具?

生信人员主要还是做序列信息的数据分析,平时自己的工作,直接跑代码运行得到结果。但如果要开发一个小工具给普通用户使用,就一个简单的上传数据,然后得到数据分析的结果,这就难倒了一大批人。前端的展示甚至比功能代码部分更让人头疼,CSS+HTML+Javascript了解一下,Django、Flask、Tornado等web框架再学习一下,简直要疯了。

好在有一些已经写好的软件包,可以让我们绕过繁琐的前端知识,做一些简单的处理,把更多的精力放在实现具体的功能上。

比如R语言的shiny系列包,比如Python语言的streamlit包等,都是这样的逻辑。但shiny要部署在服务器也有一些难度,而且很不稳定,经常报错的亚子。streamlit我还没试过,专门给数据分析师用的,希望好用。

除了web交互工具,也可以利用一些库来打包程序为GUI工具。不过GUI不如Web流行和方便了。

哎,我只是一个生物信息分析员而已,怎么要学这么多东西呢???

posted @ 2020-10-11 23:09  生物信息与育种  阅读(412)  评论(1编辑  收藏  举报