随笔分类 - 文献
摘要：Resistify是一个用于快速且准确地注释植物中的NLRs（Nucleotide-binding domain Leucine-rich Repeat，核苷酸结合域富含亮氨酸重复序列）并提供准确结构分类的工具。NLRs是植物先天免疫系统的关键组成部分，具有显著的存在/缺失变异和序列多样性。Resi
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摘要：果树基因组与遗传改良 2023年，南京农业大学吴俊教授团队发表在Plant Physiology的题为 “Genomic insights into domestication and genetic improvement of fruit crops”的长篇综述，系统总结了果树基因组学与遗传改良
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摘要：分享一篇来自南洋理工大学Marek Mutwil团队发表在《Trends in Plant Science》上有关植物生物学方向的大语言模型综述：Large language models in plant biology。生物序列本身就是一种自然语言，与LLM是天作之合，实际上生物大模型已有很多开
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摘要：分享一篇水文，来自海南热带农业资源研究所今年发表在《分子植物育种》上的一篇综述。 摘要 植物育种的未来正在朝着更高的精度、效率和可持续性发展。育种5.0代表了未来植物育种的前沿，通过基因组编辑、人工智能和大数据分析等创新技术和方法彻底改变了该领域，实现了遗传信息的整合和编辑。这将给全球农业带来革命性
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摘要：2024年6月13日，华中农业大学严建兵教授团队在Molecular Plant发表综述：Doubled Haploid Technology and Synthetic Apomixis: Recent Advances and Applications in Future Crop Breedi
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摘要：分享一篇农业大模型综述。 官网全文免费阅读 知网阅读 农业大模型：AI领域的新热点 农业大模型，基于Transformer架构，通过自监督学习方法，在大规模数据上进行训练，展现出了卓越的通用能力和强大的下游任务适应性。这些模型不仅能够处理复杂的关联表示，还在多模态信息处理等方面具有显著优势。 核心技
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摘要：20世纪30年代，Boysen和Heath通过分析叶片结构与净同化率的关系，提出了作物株型概念，明确作物生产过程中叶形和叶片数量的重要性，并进一步揭示了株型对作物生产的决定作用。随后，Donald提出有利于提高光合效率，促进作物生长发育以达高产的多性状综合的株型为理想株型。随着有关理想株型的相关研究
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摘要：近日，中国农业大学农学院汪海团队联合美国康奈尔大学、丹麦奥胡斯大学、北京大学现代农业研究院、坦桑尼亚农业科学院等单位在_PNAS在线发表了题为Modeling 0.6 million genes for the rational design of functional cis-regulatory
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摘要：在作物功能基因组学、数字育种与智慧栽培等的需求牵引下，作物表型组学近年来发展迅速。然而，作物表型组学技术及装备产品的研发与应用缺乏标准规范已成为限制作物表型产业高质量发展的瓶颈问题。 2024年6月，北京市农林科学院信息技术研究中心数字植物北京市重点实验室联合华中农业大学在中国工程院院刊_Engin
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摘要：近期，中国农科院作物所联合国内多家单位，构建了用于水稻基因组选择的大规模中国栽培稻群体数据集，提出了配套的全基因组预测深度学习模型DeepCCR，为育种者快速、高效地培育优良品种提供了有利工具。相关研究成果以简讯方式在线发表在《Plant Biotechnology Journal》上。 水稻是世界
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摘要：今年4月，华中农业大学焦文标团队在Genome Biology上发表论文：A comprehensive benchmark of graph‑based genetic variant genotyping algorithms on plant genomes for creating an a
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摘要：近日，中国农科院植保所联合扬州大学、湖南农大等在中国工程院主刊 Engineering （一区top, IF=12.8）上发表了题为《Development of Machine Learning Methods for Accurate Prediction of Plant Disease Re
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摘要：本文来自CABI的一篇综述要点。文章探讨了通过选择、杂交、诱变和重组实现的新的遗传变异性，以及植物育种技术创新如何为作物改良提供更精准和更高分辨率的方法。 引言 随着全球人口的增长和气候变化带来的挑战，粮食安全成为全球关注的重点。预计到 2050 年，世界人口将达到 100 亿，这要求我们不仅要养活
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摘要：分享来自张学勇老师的一篇综述。 遗传多样性是一个物种在自然界生存的基础，也是作物遗传改良的基石。经过近100年的考察、收集、评价、编目、入库，全球收集种质资源约740万份，存放在1750个种质库中；我国收集各类作物种质资源总量达50万份。丰富的资源一方面为作物改良奠定了基础，另一方面也带来了困扰，即
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摘要：北京市农林科学院信息技术研究中心赵春江院士团队联合华中农业大学杨万能教授团队发布在PBJ上的综述文章：Plant microphenotype: from innovative imaging to computational analysis，深入探讨了植物微观表型（microphenotype）
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摘要：分享一篇水稻种质资源创新研究与利用的相关综述，内容比较全面，包括了我国水稻种质资源收集、评价与精确鉴定、水稻新品系创制、水稻杂种优势利用、水稻种质创制新技术、新方法以及水稻优异基因资源的挖掘与利用等方面。 截止到2023 年，我国保存的作物种质资源有超过54 万份，其中有8 万多份是水稻种质资源，数
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摘要：本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具，并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。 水稻基因组数据库 水稻转录和转录后调控数据库 水稻基因网络数据库 水稻种质资源信息数据库 水稻常用的基因编辑系统 水稻基因编辑生物信息工具与数据库 水稻智能育种生物信息工具 专家简介:
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摘要：品种是玉米高产的基础，进一步提高品种耐密性和种植密度是提高玉米单产的关键。 在近80 年中，美国玉米单产提升了近8 倍，这个过程中种植密度从平均每亩2000 多株增加到近6000 株，种植密度贡献显著。 我国高产玉米新品种更新迭代过程中，玉米株型也逐渐从平展型演变成紧凑型，品种的耐密性明显提高，但和
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摘要：近日，《生物技术通报》特邀浙江大学农业与生物技术学院陈露研究员（原严建兵老师学生）团队发表综述《玉米野生种基因组研究进展及应用》。本文主要综述了大刍草的基因组进化、数量遗传学、群体遗传学等方面的研究进展，同时对大刍草在未来玉米遗传育种中的应用进行了展望。 玉米的野生近缘种，被统称为大刍草（teosi
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摘要：近日，《生物技术通报》特邀扬州大学农学院徐辰武教授团队发表综述《作物全基因组选择育种技术研究进展》。本文首先分析了影响作物GS功效的主要因素，继而从非加性效应模型、群体构建方案、多性状与多环境预测、多组学预测和育种芯片技术现状等方面阐述了GS技术在作物育种中的研究进展，并指出研究所面临的问题和发展前
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