随笔分类 -  工具

摘要:[toc] 一、iMetaLab简介 宏蛋白组学是个非常小众的领域,即使从事的学者也并非专门做这个,大多是作为系统生物学的延伸研究。业界有几个比较有影响力的研究团队,一是比利时根特大学的 "(COMPOMICS)" 团队,开发了有代表性的宏蛋白分析工具如 "Unipept" 、 "MetaProte 阅读全文
posted @ 2020-05-13 15:23 生物信息与育种 阅读(1337) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1. docker是啥? 自行Google或百度去。。。 "https://yeasy.gitbooks.io/docker_practice/introduction/what.html" 重要概念: 镜像 image :一个特殊的 root 文件系统,除了提供容器运行时所需的程序、库、资源、配置 阅读全文
posted @ 2020-04-23 11:40 生物信息与育种 阅读(209) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:[toc] 1. eggNOG简介 最近考虑到所用的一些数据库太旧了,需要更新。在整理的时候发现eggNOG数据库在去年的时候已经做了一次更新 "eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated ortho 阅读全文
posted @ 2020-04-22 17:47 生物信息与育种 阅读(10349) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:前言 关于蛋白质组学,你是不是已经听了太多公司的宣讲,介绍了一大堆的技术名词,反而越听越懵懂,脑袋一团乱麻?就和传话游戏一样,当我们接收了多手信息以后,得到的信息就越不准确。那么,何不自己看一看第一手信息呢?比如说DIA。 这里只推荐两篇综述。 第一篇是蛋白质组学泰山北斗的Ruedi Aeberso 阅读全文
posted @ 2020-04-02 23:16 生物信息与育种 阅读(5799) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:简介 Atom 是 Github 开源的文本编辑器,相当于半个IDE。其特点如下: (1)免费开源,多平台支持(Windows、Mac、Linux); (2)界面美观、现代化,使用舒适; (3)多文件管理(文件树列表功能); (4)设置管理很方便,不用像Sublime需要自己手动安装第三方管理插件; 阅读全文
posted @ 2020-03-31 11:04 生物信息与育种 阅读(419) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:原理 Git 命令很多,但日常使用只要记住下图的6个主要命令,就可以了。 工作区(Working Directory) 在git管理下的正常目录都算是工作区。就是你平时存放项目代码的地方。 暂存区(Stage/Index) 暂存区,用于临时存放你的改动,事实上它只是一个文件,保存即将提交到文件列表信 阅读全文
posted @ 2020-03-18 18:01 生物信息与育种 阅读(205) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:tmux(terminal multiplexer) 是Linux上的终端复用神器。 1. 安装 (1)下载 下载及其依赖软件。 (2)安装 先安装依赖,再安装tmux。 (3)设置环境 设置环境变量。 2. 常用命令使用 tmux的结构包括 会话(session)、窗口(window)、窗格(pa 阅读全文
posted @ 2020-03-09 22:39 生物信息与育种 阅读(4617) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:外观 Ctrl+滚轮改变字体大小:file -> Setting ->Editor-〉General -> Mouse; 字体、颜色:file->settings->Editor; 主题:file->settings->Editor->appearance->theme 注释颜色:File-->Se 阅读全文
posted @ 2020-02-14 16:20 生物信息与育种 阅读(852) 评论(0) 推荐(0) 编辑