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摘要: 使用bcftools的counts插件查看vcf文件的信息 阅读全文
posted @ 2021-12-23 22:56 Minerw 阅读(4403) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在shell循环中,对已有的字符串变量循环拼接赋值 阅读全文
posted @ 2021-12-20 16:35 Minerw 阅读(3753) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 翻译了原文的摘要和引言部分 阅读全文
posted @ 2021-10-12 22:21 Minerw 阅读(348) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一般来说,我们可以使用Keras包中的fit函数进行模型的训练,其参数如下: Model.fit( x=None, y=None, batch_size=None, epochs=1, verbose="auto", callbacks=None, validation_split=0.0, val 阅读全文
posted @ 2021-08-24 15:52 Minerw 阅读(3774) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 问题引入 当我们需要对一批数据做曲线拟合的时候,来自python的scipy包下的curve_fit()函数往往是一个不错的选择,但curve_fit()函数返回的结果只有拟合曲线的参数popt和参数的估计协方差pcov(etismatated covarianve of popt)[1]。而作为回 阅读全文
posted @ 2021-08-23 15:12 Minerw 阅读(7646) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 材料和方法 本研究中所有的统计分析都是使用R 的3.6.0版[31]进行的,图像是使用R包ggplot 3.2.1版[32]制作的。我们的R包RAINBOWR是使用R包Rcpp 1.0.2版[33-35]和RcppEigen 0.3.3.5.0版[36]实现的,以减少下面描述的多核混合效应模型所需的 阅读全文
posted @ 2021-07-23 21:22 Minerw 阅读(270) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 原文标题:RAINBOW: Haplotype-based genome-wide association study using a novel SNP-set method 摘要 难以检测罕见变异是传统全基因组关联分析(GWAS)中的问题之一。这个问题与有多个等位基因组成的复杂基因组成密切相关, 阅读全文
posted @ 2021-07-21 18:04 Minerw 阅读(743) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: R包RAINBOWR的Readme 阅读全文
posted @ 2021-07-02 10:42 Minerw 阅读(391) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 原文标题:A tutorial on conducting genome-wide association studies: Quality control and statistical analysis 原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29484742/ 阅读全文
posted @ 2021-06-30 20:34 Minerw 阅读(1328) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要: 原文标题:A tutorial on conducting genome-wide association studies: Quality control and statistical analysis 原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29484742/ 阅读全文
posted @ 2021-06-28 16:29 Minerw 阅读(1441) 评论(0) 推荐(0) 编辑