linux并行环境及mpich2安装全过程
linux并行环境及mpich2安装全过程
准备工作:
1、设置IP(在这里我们设置c1、c2、c3、c4的ip地址分别为192.168.0.1、192.168.0.2、192.168.03、192.168.0.4)
#vi /etc/sysconfig/network-script/ifcfg-eth[0、1、2、3]其中数字与所修改的机器网卡实际编号一致
#service network restart
每个节点都要进行上面的操作
2、更改主机名为c1、c2、c3、c4
#vi /etc/sysconfig/network
HOSTNAME=c1
c2、c3、c4操作和c1相同
例如:
[root@c2 ~]# cat /etc/sysconfig/network
NETWORKING=yes
HOSTNAME=c2
一、创建SSH信任连接(在root目录下)
1、更改/etc/hosts文件
#vi /etc/hosts 打开hosts文件,更改如下:
127.0.0.1 localhost.localdomain localhost
192.168.0.1 c1
192.168.0.2 c2
192.168.0.3 c3
192.168.0.4 c4
例如:
[root@c2 ~]# cat /etc/hosts
# Do not remove the following line, or various programs
# that require network functionality will fail.
127.0.0.1 localhost.localdomain localhost
192.168.0.1 c1
192.168.0.2 c2
192.168.0.3 c3
192.168.0.4 c4
2、在c1生成SSH秘钥对.
#ssh-keygen -t rsa 回车即可,产生.ssh文件,
口令选为空,生成密钥对,公钥写入/root/.ssh/id_rsa.pub,密钥写入/root/.ssh/id_rsa
#ls -a 查看是否有.ssh文件夹
3、生成authorized_keys文件建立对c2的信任连接
#scp /root/.ssh/id_rsa.pub 192.168.0.2:/root/.ssh/
#ssh 192.168.0.2 cat /.ssh/id_rsa.pub>>/root/.ssh/authorized_keys
查看c2 是否有authorized_keys文件,有则将id_rsa.pub内容复制进c2该文件
#scp /root/.ssh/id_rsa.pub 192.168.0.2 /.ssh/authorized_keys
无则将id_rsa.pub复制为远程该文件
4、退出到root目录
#cd ..
5、建立本身的信任连接
#ssh c2 按提示输入yes(三个字母要打全)
设置c1对c3和c4的方法与c1相同
6、对c2、c3和c4进行类似上面的操作
7、确认3台机器的信任连接已建立
对每个节点执行:
#ssh c1
#ssh c2
#ssh c3
#ssh c4
在提示处输入yes回车,最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆("Last login:时间日期"提示信息除外)
二、安装MPICH2(在节点root目录下)
1、解压缩
#tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz
或者 #gunzip -c mpich2-1.0.1.tar.gz|tar xf mpich2-1.0.1.tar
2、创建安装目录
#mkdir /usr/MPICH-install
3、进入mpich2解压目录
#cd mpich2-1.0.1
4、设置安装目录
#./configure --prefix=/usr/MPICH-install
5、编译
#make
6、安装
#make install
7、退出到root目录
#cd ..
8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量
#vi .bashrc
修改后的.bashrc文件如下:
# .bashrc
# User specific aliases and functions
PATH=$PATH:/usr/MPICH-install/bin 新增加的
#Source .bashrc
9、测试环境变量设置
#which mpd
#which mpicc
#which mpiexec
#which mpirun
10、修改/etc/mpd.conf文件,内容为secretword=myword
#vi /etc/mpd.conf
设置文件读取权限和修改时间
#touch /etc/mpd.conf
#chmod 600 /etc/mpd.conf
11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts
#vi mpd.hosts
文件内容如下:
C1
C2
C3
c4
三、测试
1、本地测试
#mpd & 启动
#mpdtrace 观看启动机器
#mpdallexit 退出
2、通过mpd.hosts运行集群系统
#mpdboot -n number -f mpd.hosts number为要起动的机器个数
#mpdtrace
#mpdallexit
3、测试运行MPICH的例子程序
#mpdboot -n 4 -f mpd.hosts 启动4台机器
#mpiexec -n number /usr/MPICH-install/examples/cpi number为使用的进程数
#mpdallexit
4、如果测试不能通过,请进行第四步
四、问题解决
1、通过mpdcheck获得一写帮助信息
#mpdcheck -pc
2、查错
#mpdcheck -l
3、通过mpd.hosts文件查错
#mpdcheck -f mpd.hosts 如果无错误
#mpdcheck -f mpd.hosts -ssh
4、如果上述无错误,可略过此步
对任意两台机器进行查错
m1: #mpdcheck -s 输出主机名host和端口port
m2: #mpdcheck -c host port
注意:以上四步都是在没有运行mpd的情况下进行的
5、mpd查错
m1: #mpd -e & 返回使用的端口
m2: #mpd -h m1 -p echoed_port_m1 &
完成安装