随笔分类 - 翻译

【译】Amber20_Introduction

摘要：Amber是一套程序的总称，它允许用户进行分子动力学模拟，特别是对生物大分子进行模拟。Amber中没有一个单独的程序使用这个名字，但是各个部分协同工作，并为许多常见的计算提供一个强大的框架平台。术语Amber也被用来指代Amber软件开发实现的经验力场。然而，应该认识到，代码和力场是分开的：其他几个阅读全文

posted @ 2022-12-19 22:57 matrixray 阅读(805) 评论(0) 推荐(1) 编辑

【译】Desmond2022-4

摘要：1.简介 Desmond是由D. E. Shaw Research开发的显性溶剂分子动力学程序。Desmond是从头开始创建的，重点是准确性、速度和可扩展性。它支持现代分子动力学程序中许多最受欢迎的功能，包括：在GPU上高度可扩展的并行执行使用立方体、正方体和三棱体模拟盒进行具有周期性边界条件的阅读全文

posted @ 2022-12-06 20:17 matrixray 阅读(1605) 评论(0) 推荐(0) 编辑