SSIS 中的文件系统任务 (File System Task) 经常被用来执行与 Windows 系统下文件操作相关的操作，比如建立目录、删除目录、删除目录下的文件和在目录之间移动文件等。文件系统任务编辑器中的 Operation 选项用来控制文件系统任务所要执行的操作，其他的选项是根据 Operation 的选项出现的，比如如果选择了 Create Directory (建立目录)，其他的选项就会有Destination Directory Options 下的 UseDirectoryIfExists, Source Connection 用于建立数据操作源的连接等。
