CentOS 5.5上安装MPICH2

环境为CentOS 5.5，gcc-4.1.2

节点

• 192.168.111.150    gserver150
• 192.168.111.156    gserver156
• 192.168.111.157    gserver157
• 192.168.111.158    gserver158

192.168.111.150作为主节点，各节点用户名统一为：geobeans。

1. 设置ssh无密码登录，参考(SSH无密码登录)

2.编译安装MPICH2

1) 下载mpich2（版本1.4.191）

http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/downloads/tarballs/1.4.1p1/mpich2-1.4.1p1.tar.gz

2) 编译mpich2

$ tar zxvf mpich2-1.4.1p1.tar.gz
$ cd mpich2-1.4.1p1
$ ./configure --prefix=/opt/mpich2-1.4.1p1 --with-pm=hydra:mpd --with-mpe
$ make
$ sudo make install
mpich2-1.4.1p1的安装目录内容为：

/opt/mpich2-1.4.1p1/bin目录为

3.配置MPICH2

安装完MPICH2，需要对MPICH2进行配置。在每个节点上都必须配置。

1）配置环境变量（/etc/profile）

 $ sudo vi /etc/profile

在/etc/profile的底部添加下面几行
export MPI_ROOT=/opt/mpich2-1.4.1p1
export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH
export MANPATH=$MPI_ROOT/bin:$MANPATH

执行下面命令使/etc/profile生效

$ source /etc/profile

 

2) 测试环境变量

$ which mpd
$ which mpicc
$ which mpiexec
$ which mpirun

3）创建配置文件.mpd.conf

 root用户和普通用户的mpd.conf存储位置是不同的。

  * root用户

  root用户下mpd.conf位于/etc路径下，文件名为"mpd.conf"

* 普通用户

   普通用户的mpd.conf位于~/路径下，文件名为".mpd.conf "。注意，文件名多了一个点

   mpd.conf的内容为secretword=myword

注意：各个节点上的mpd.conf文件必须相同

4）创建配置文件mpd.hosts

路径：~/mpd.hosts。

内容：mpd.hosts记录MPICH2集群上节点的机器名或IP地址。

例如：

 

5、启动单点mpi

1) 执行命令

 $ mpd &

 2) 执行mpdtrace

6、启动mpi集群

1) 关闭防火墙

 #service iptables stop

 查看防火墙状态

#service iptables status

 2) 启动mpi集群

$mpdboot -n 4 -f mpd.hosts -v

 启动成功

3) 查看mpi集群

$mpdtrace -l

 

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8、FAQ

1）mpdboot_gserver150 (handle_mpd_output 421): failed to connect to mpd on gserver156

      场景：gserver156上的mpd已经启动，gserver156上的设置与150上的设置一模一样

      原因：~/.mpd.conf在各节点上的内容不一致时，可能出现这个问题

 

2）failed to handshake with mpd on gserver157

      原因： 防火墙没有关

      解决：/sbin/service iptables stop

 

3）mpdboot_gserver156 (handle_mpd_output 426): from mpd on gserver158, invalid port info:

      原因：ssh无密码登录配置不对