pymysql 读取大数据内存卡死的解决方案
背景:目前表中只有5G(后期持续增长),但是其中一个字段(以下称为detail字段)存了2M(不一定2M,部分为0,平均下来就是2M),字段中存的是一个数组,数组中存N个json数据。这个字段如下:
[{"A": "A", "B": "B", "C": "C", "D": "D"}...]
要是拆表的话,可能要拆好多个,要是存多行根据阿里巴巴《Java 开发手册》提出单表行数超过 500 万行,也不是很建议。希望有大佬能指教一下。
回到正题,一开始是分两个表存储,一个表存基本信息(A表),一个表(B表)存关联字段,及detail字段。貌似没有啥用,按需求现要将两张表合在一起供BI去处理。直接复制了那张基础字段的A表,通过遍历B表根据关联字段进行更新。但是在select的时候内存读入的数据太大直接卡死(狗头)。于是在网上查找如何通过pymysql处理大数据的问题。解决方案如下:
1.通过limit分批次读取数据进行操作:
import pymysql
up_db = pymysql.connections.Connection(host=MYSQL_HOST,
port=MYSQL_PORT,
user=MYSQL_USER,
password=MYSQL_PASSWORD,
db=MYSQL_DB,
charset='utf8mb4',)
count = 0
while True:
# if count == 2:
# break
select_sql = "select sec_report_id,detail from sec_report_original_data_detail limit %s,2"%(count)
up_cursor = up_db.cursor()
up_cursor.execute(select_sql)
result = up_cursor.fetchall()
for data in result:
sec_report_id = data[0]
detail = data[1]
update_sql = "update `sec_report_original_data_intact` set detail = '%s' where `sec_report_id` = '%s' " % (
db.escape_string(detail), sec_report_id)
print(update_sql)
res = up_cursor.execute(update_sql)
if res:
print(res)
up_db.commit()
print(f'{sec_report_id}插入成功')
count+=2
可以解决问题,不过只是拿了几条做测试(我用的是第二种),这里没写终止条件,有朋友要用的话自己加上。
2.通过pymysql的SSCursor
没有缓存的游标
pymysql.cursors.SSCursor
代替默认的cursor
会从数据库中一条一条的读取记录,从而不会造成内存卡死,但是也有需要注意的地方:
- 这个游标对象只能读完所有行之后才能处理其他sql。如果你需要并行执行sql,需要重新生成一个连接
- 必须一次性读完所有行,每次读取后处理数据要快,不能超过60s,否则mysql将会断开这次连接(没有遇到这个问题,遇到的可以讨论一下)
import pymysql
db = pymysql.connections.Connection(host=MYSQL_HOST,
port=MYSQL_PORT,
user=MYSQL_USER,
password=MYSQL_PASSWORD,
db=MYSQL_DB,
charset='utf8mb4',
cursorclass=pymysql.cursors.SSDictCursor)
up_db = pymysql.connections.Connection(host=MYSQL_HOST,
port=MYSQL_PORT,
user=MYSQL_USER,
password=MYSQL_PASSWORD,
db=MYSQL_DB,
charset='utf8mb4',)
up_cursor = up_db.cursor()
cursor = pymysql.cursors.SSCursor(db)
select_sql = "select sec_report_id,detail from sec_report_original_data_detail"
cursor.execute(select_sql)
result = cursor.fetchone()
try:
while result is not None:
sec_report_id = result[0]
detail = result[1]
update_sql = "update `sec_report_original_data_intact` set detail = '%s' where `sec_report_id` = '%s'"%(db.escape_string(detail),sec_report_id)
res = up_cursor.execute(update_sql)
if res:
print(res)
up_db.commit()
print(f'{sec_report_id}插入成功')
result = cursor.fetchone()
except Exception as e:
print(e)
finally:
up_cursor.close()
cursor.close()
db.close()
解决了一次性读取大数据的方法,但是没找到特别好的存储那个
detail
字段中数据的办法,有朋友了解的可以沟通一下。
焚膏油以继晷,恒兀兀以穷年。