java题目HJ63 DNA序列

描述

一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例（定义为 GC-Ratio ）是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。

给定一个很长的 DNA 序列，以及限定的子串长度 N ，请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。

DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等，但是没有 AGT ， CT 等等

 

数据范围：字符串长度满足 1 \le n \le 1000 \1≤n≤1000  ，输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母

输入描述：

输入一个string型基因序列，和int型子串的长度

输出描述：

找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串

示例1

输入：

ACGT
2

复制

输出：

CG

复制

说明：

ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个，其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5，CG为1，故输出CG   

示例2

输入：

AACTGTGCACGACCTGA
5

复制

输出：

GCACG

复制

说明：

虽然CGACC的GC-Ratio也是最高，但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串，所以只能输出GCACG。

 

 

import java.io.*;
import java.util.*;


/*
思路：从索引0开始遍历整个字符串，找出GC值最大的子字符串
*/
public class Main {
    public static void main(String[] args) throws IOException {
        Scanner sc = new Scanner(System.in);
        while(sc.hasNext()) {
            String s = sc.next();
            int n =sc.nextInt();
            int countGC = 0;
            String result = null;
            for(int i =0; i<=s.length()-n;i++){
                int tmpcountGc =0;
                String s1 = s.substring(i,i+n);  //取子字符串
                for(int j =0; j<s1.length();j++) {
                    if(s1.charAt(j) == 'G' || s1.charAt(j) == 'C') {
                        tmpcountGc++;  //子字符串的GC次数
                    }
                }
                if( tmpcountGc > countGC) {  //如果当前GC大于上一次
                    countGC = tmpcountGc;  //更新GC次数
                    result = s1;  //更新要输出的字符串结果
                } else if(tmpcountGc == countGC) {   //如果当前GC 和上一次一样
                    result = result;  //保持输出结果不变
                }
            }
            System.out.println(result);
        }
    }
}