java题目HJ63 DNA序列
描述
一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例(定义为 GC-Ratio )是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。
给定一个很长的 DNA 序列,以及限定的子串长度 N ,请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。
DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等,但是没有 AGT , CT 等等
数据范围:字符串长度满足 1 \le n \le 1000 \1≤n≤1000 ,输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串
示例1
输入:
ACGT 2
输出:
CG
说明:
ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG
示例2
输入:
AACTGTGCACGACCTGA 5
输出:
GCACG
说明:
虽然CGACC的GC-Ratio也是最高,但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串,所以只能输出GCACG。
1 import java.io.*; 2 import java.util.*; 3 4 5 /* 6 思路:从索引0开始遍历整个字符串,找出GC值最大的子字符串 7 */ 8 public class Main { 9 public static void main(String[] args) throws IOException { 10 Scanner sc = new Scanner(System.in); 11 while(sc.hasNext()) { 12 String s = sc.next(); 13 int n =sc.nextInt(); 14 int countGC = 0; 15 String result = null; 16 for(int i =0; i<=s.length()-n;i++){ 17 int tmpcountGc =0; 18 String s1 = s.substring(i,i+n); //取子字符串 19 for(int j =0; j<s1.length();j++) { 20 if(s1.charAt(j) == 'G' || s1.charAt(j) == 'C') { 21 tmpcountGc++; //子字符串的GC次数 22 } 23 } 24 if( tmpcountGc > countGC) { //如果当前GC大于上一次 25 countGC = tmpcountGc; //更新GC次数 26 result = s1; //更新要输出的字符串结果 27 } else if(tmpcountGc == countGC) { //如果当前GC 和上一次一样 28 result = result; //保持输出结果不变 29 } 30 } 31 System.out.println(result); 32 } 33 } 34 }