MS中石墨烯建模

MS:

导入graphite （in thefile ofstructure-ceramics ), 然后build -Symmetry-make P1.
然后切掉中间一层。然后切掉其中一层，将剩下的一层移到c轴中间附近。
bulid-Symmetry-find symmetry-impose symmetry。 这样就得到了 honeycomb lattice primitive cell。
如果需要大片结构，可以用bulid - symmetry - Surpercell 来构建。。。得到菱形格子。
如果需要正交格子，将primitive cell 通过supercell2*2 然后，然后留下立方格子的4个原子，其他切掉。重新构建晶格，build-rebuild 晶格参数，a=4.26， b=2.46 ，c=15。（通过几何换算得出，或者又构型量出） 角度全为90度。如果需要更大体系，同菱形，用supercell创建

经过自己反复尝试，始终不能把菱形变成正交盒子。遂放弃。 下面介绍使用VMD 构建石墨烯，然后导入MS的过程。

1.