2018年4月28日
Circos Ubuntu 安装
摘要： 下载: http://www.circos.ca/software/download/circos/ Perl 需要5.8及以上的版本. 查看版本的命令: perl -v 解压安装包 安装包是一个tgz(.tar.gz的缩写)压缩包, 用tar vxzf解压. 进行解压后的文件夹, 执行: ./bi 阅读全文
posted @ 2018-04-28 16:42 luxliy 阅读(751) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2017年11月13日
Python基础知识
摘要： 1, Python 要求代码块缩进，通过缩进来指示分组。 2，为了降低复杂性，通常把数据组织为列表。如 顾客列表，朋友列表，购物清单等。 movie=["TOM","LOVE","PRINCESS"] 规则：1）数据两边加引号，将各个电影名转化为字符串 2）用逗号将列表项与下一项分开； 3）在列表的 阅读全文
posted @ 2017-11-13 14:56 luxliy 阅读(229) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2017年10月18日
awk编程--将genomefile按chromosome coordinate 划分window/bin（chrombinFile）
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posted @ 2017-10-18 22:37 luxliy 阅读(1) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Shell---awk用法
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posted @ 2017-10-18 22:30 luxliy 阅读(0) 评论(0) 推荐(0) 编辑
bedtools-Documentation
摘要： https://media.readthedocs.org/pdf/bedtools/latest/bedtools.pdf 阅读全文
posted @ 2017-10-18 22:00 luxliy 阅读(122) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Shell--cut用法
摘要： cut是以每一行为一个处理对象的，这种机制和sed一样。 cut接受三个定位方法： 1）byte： -b 2）characters： -c 3）fields： -d eg：提取第3,4,5,9的字节： cut -b 3-5,9 注意：cut命令如果使用-b选项，执行时会先把-b后面所有的定位进行从小 阅读全文
posted @ 2017-10-18 21:57 luxliy 阅读(10425) 评论(0) 推荐(0) 编辑
CNV(case-control)tools--SynthEx 使用步骤
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posted @ 2017-10-18 21:30 luxliy 阅读(1) 评论(0) 推荐(0) 编辑