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摘要： 版权声明：本文源自 解螺旋的矿工， 由 XP 整理发表，共 13781 字。 转载请注明：从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第4节 构建WGS主流程 | Public Library of Bioinformatics 转载地址：https://www.plob.org/article 阅读全文

摘要： 1. 对原始下机fastq文件进行过滤和比对（mapping） 对于Illumina下机数据推荐使用bwa进行mapping。 Bwa比对步骤大致如下： （1）对参考基因组构建索引： 例子：bwa index -a bwtsw hg19.fa。最后生成文件：hg19.fa.amb、hg19.fa.a 阅读全文

摘要： windows下 的anaconda安装tensorflow： 在Anaconda Prompt中：conda install tensorflow python=3.5一直下载失败.总结一下原因可能国外的源，网速太慢且不稳定 借鉴http://www.cnblogs.com/nosqlcoco/p 阅读全文

摘要： Numpy 1. np. shape np.reshape np.prod() astype() dtype() From keras.layers import Input Input():用来实例化一个keras张量 keras张量是来自底层后端（Theano或Tensorflow）的张量对象， 阅读全文

摘要： 异常点检测算法（一） 1.基于正态分布的一元离群点检测方法 在正态分布的假设下，区域 包含了99.7% 的数据，如果某个值距离分布的均值 超过了 ，那么这个值就可以被简单的标记为一个异常点（outlier）。 2. 多元离群点的检测方法 （1）基于一元正态分布的离群点检测方法 在正态分布的假设下，如 阅读全文

摘要： 转：https://shengxin.ren/article/16 https://www.cnblogs.com/lmt921108/p/7442699.html 批量下载SRA http://www.360doc.com/content/18/0428/15/48272598_749456477 阅读全文

摘要： 相关： 偏相关，自相关，互信息，等级相关 相关系数度量指的是两个不同事件彼此之间的相互影响程度；而自相关系数度量的是同一事件在两个不同时期之间的相关程度，形象的讲就是度量自己过去的行为对自己现在的影响。 自相关，也称 序列相关。是一个信号于其自身在不同时间点的互相关。非正式地来说，它就是两次观察之间 阅读全文

摘要： RandomAccessFile 用来支持读写随机存取文件的类。提供“文件指针”，类似于游标和下标，使用getFilePointer()方法获得，利用seek()方法设置下标。 public RandomAccessFile(String name, String mode){} mode：文件操作 阅读全文

摘要： 1，先将R包下载到本地 2，getwd() setwd("F:\\CNV\\Paper\\Case-control\\mHMM") 3, install.packages("mHMM_1.0.zip",repos=NULL) 4, library(mHMM) 阅读全文

摘要： 两种方式设置环境变量： 1，添加到环境变量路径$PATH中 # 加到PATH末尾 export PATH=$PATH:/path/to/your/dir # 加到PATH开头 export PATH=/path/to/your/dir:$PATH 2，命名一个新带环境变量 环境变量的作用域通常有三个 阅读全文