摘要: GATK的pipeline使用WDL进行编写 WDL是一种流程管理语言,内置的支持并行,适合编写pipeline 运行wdl脚本需要两步:第一步编辑参数列表对应的json文件,第二步直接运行Cromwell.jar eg 对于一个WDL脚本,有5个核心结构: 1,workflow 2, task:代 阅读全文
posted @ 2018-10-16 17:24 luxliy 阅读(2384) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 版权声明:本文源自 解螺旋的矿工, 由 XP 整理发表,共 13781 字。 转载请注明:从零开始完整学习全基因组测序(WGS)数据分析:第4节 构建WGS主流程 | Public Library of Bioinformatics 转载地址:https://www.plob.org/article 阅读全文
posted @ 2018-10-16 15:49 luxliy 阅读(14530) 评论(0) 推荐(1) 编辑