2018年10月15日
【转】 GATK--原始数据预处理
摘要： 1. 对原始下机fastq文件进行过滤和比对（mapping） 对于Illumina下机数据推荐使用bwa进行mapping。 Bwa比对步骤大致如下： （1）对参考基因组构建索引： 例子：bwa index -a bwtsw hg19.fa。最后生成文件：hg19.fa.amb、hg19.fa.a 阅读全文
posted @ 2018-10-15 10:52 luxliy 阅读(1152) 评论(0) 推荐(0) 编辑