摘要：
初学java，希望旅途愉快 :)类型决定对象的接口，（有人认为类是类型的特定实现），接口确定对象所能发出的请求（消息），满足请求的代码和隐藏的数据一起构成实现；对象设计时，应该很好地完成一项任务，并且不试图做更多的事情；继承实现多态，导出类将包括基类的所有成员以及接口，因此，导出类与基类具有相同类型；一个完善的基类应该包括所有子类都通用的接口，由导出类设计基类的具体接口实现，并将对象所属的类型当... 阅读全文
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如果你被问道，你相信这世界上有鬼吗？或许你会觉得这个人是不是疯掉了。我觉得，鬼是肯定有的，或许你会认为我是不是神棍或者哪个疯人院里放出来的。可是，如果没有鬼，那么我们平时口口相传的鬼到底是什么？没有什么东西是可以凭空产生的（这是我坚信的鬼神之一），既然我们可以讨论鬼，那么鬼肯定以某种形式存在。举个简... 阅读全文
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scipy在numpy的基础上提供了众多的数学、科学以及工程计算中常用的模块；是强大的数值计算库；1. 常数和特殊函数scipy的constants模块包含了众多的物理常数：import scipy.constants as CC.c #真空中的光速C.h #普朗克常数C.pi #圆周率在C.physical_constants字典中，通过物理常数的名称访问该物理常数，如：C.physica... 阅读全文
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1. 线性代数numpy对于多维数组的运算在默认情况下并不使用矩阵运算，进行矩阵运算可以通过matrix对象或者矩阵函数来进行；matrix对象由matrix类创建，其四则运算都默认采用矩阵运算，和matlab十>分相似：a = np.matrix([[1,2,3],[4,5,6],[7,8,9]])matrix([[1, 2, 3],[4, 5, 6],[7, 8, 9]])a * amatri... 阅读全文
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1.常规函数与排序常用统计函数：求和：sum()、均值：mean()、标准差：std()、方差：var()、最小值：min()、最大值：max()、最大值与最小值之差：ptp()、最大值的下标：argmax()、最小值的下标：argmin()、中值：median()上述函数都可以指定axis，来沿着某一轴操作；除了mean()函数求均值，还可以使用average()，并且可以指定weights参数... 阅读全文
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多维数组下标多维数组的下标是用元组来实现每一个维度的，如果元组的长度比维度大则会出错，如果小，则默认元组后面补 : 表示全部访问；如果一个下标不是元组，则先转换为元组，在转换过程中，列表和数组的转换有所不同。一个列表会被转换成各个元素组成的元组，然后进行访问（此时如果不全为整数的话，则不会共享存储区域，因为无法通过改变步长来保持存储结构不变）；如：lidx=[[0],[1],[2]]；如果用lid... 阅读全文
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Mayavi是python的一个包，提供方便的可视化方案。目前（20150809）Mayavi还没有py3的支持，以下安装环境在python 2.7.10下进行安装Mayavi：1. 通过pip install mayavi自动检测并且安装大部分的依赖包： apptools、traits、trai... 阅读全文
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网上应该可以找到很多关于ubuntu源的设置方法，但是如果不搞清楚就随便设置的话，不仅不能起到应有的效果，还会由于一些问题导致apt不可用。最正确的更换源的方法应该如系统提示的：## a.) add 'apt_preserve_sources_list: true' to /etc/cloud/cl... 阅读全文
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pandaseq是一款非常好用的序列拼接软件，项目传送：https://github.com/neufeld/pandaseq/ （编译安装前需要libtool-devel）所谓科技服务和科研态度有的时候真的不统一，在pandaseq拼接的时候，如果输出fastq文件，overlap部分，如果错配的... 阅读全文
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echo " ls *.$2 | while read file;do out=$( (grep -n $1 $file) ) [ -n \"$out\" ] && echo $file,$out;done">search.sh搜索：sh search.sh get_longest_overlap ... 阅读全文