摘要：
1 QC：逐条过滤，内存不大，如果是压缩文件取决于缓冲大小，一般设置1G；2 SOAPAligner：比对需要读入reference，取决于reference大小，比较大的如人类hg19和细菌，设置15G左右；3 SOAP denovo：组装软件，取决于数据量，大约设置为数据量的10倍，一般高... 阅读全文
摘要：
在对之前的ITS数据(454数据)做split时，发现有一些reads没有被匹配上，但是barcode能够完全匹配，虽然之后的primer在中间漏了一个碱基，导致后面的碱基全部误匹配，从而导致这条reads没有被匹配上的问题。终于解决Qiime的问题后，使用split_libraries.py 做切... 阅读全文