TableInputFormat分片及分片数据读取源码级分析
我们在MapReduce中TextInputFormat分片和读取分片数据源码级分析 这篇中以TextInputFormat为例讲解了InputFormat的分片过程以及RecordReader读取分片数据的过程。接下来咱们分析TableInputFormat的分片信息和数据读取过程。
TableInputFormat这是专门处理基于HBase的MapReduce的输入数据的格式类。我们可以看看继承结构:(1)public class TableInputFormat extends TableInputFormatBase implements Configurable;(2)public abstract class TableInputFormatBase extends InputFormat<ImmutableBytesWritable, Result>。其中InputFormat是输入格式的基类。
TableInputFormat类主要是构造HTable对象和Scan对象,主要在方法setConf(Configuration configuration)构造,代码如下:
1 /** 2 * Sets the configuration. This is used to set the details for the table to 3 * be scanned. 4 * 5 * @param configuration The configuration to set. 6 * @see org.apache.hadoop.conf.Configurable#setConf( 7 * org.apache.hadoop.conf.Configuration) 8 */ 9 @Override 10 public void setConf(Configuration configuration) { 11 this.conf = configuration; 12 String tableName = conf.get(INPUT_TABLE); 13 try { 14 setHTable(new HTable(new Configuration(conf), tableName)); 15 } catch (Exception e) { 16 LOG.error(StringUtils.stringifyException(e)); 17 } 18 19 Scan scan = null; 20 21 if (conf.get(SCAN) != null) { 22 try { 23 scan = TableMapReduceUtil.convertStringToScan(conf.get(SCAN)); 24 } catch (IOException e) { 25 LOG.error("An error occurred.", e); 26 } 27 } else { 28 try { 29 scan = new Scan(); 30 31 if (conf.get(SCAN_ROW_START) != null) { 32 scan.setStartRow(Bytes.toBytes(conf.get(SCAN_ROW_START))); 33 } 34 35 if (conf.get(SCAN_ROW_STOP) != null) { 36 scan.setStopRow(Bytes.toBytes(conf.get(SCAN_ROW_STOP))); 37 } 38 39 if (conf.get(SCAN_COLUMNS) != null) { 40 addColumns(scan, conf.get(SCAN_COLUMNS)); 41 } 42 43 if (conf.get(SCAN_COLUMN_FAMILY) != null) { 44 scan.addFamily(Bytes.toBytes(conf.get(SCAN_COLUMN_FAMILY))); 45 } 46 47 if (conf.get(SCAN_TIMESTAMP) != null) { 48 scan.setTimeStamp(Long.parseLong(conf.get(SCAN_TIMESTAMP))); 49 } 50 51 if (conf.get(SCAN_TIMERANGE_START) != null && conf.get(SCAN_TIMERANGE_END) != null) { 52 scan.setTimeRange( 53 Long.parseLong(conf.get(SCAN_TIMERANGE_START)), 54 Long.parseLong(conf.get(SCAN_TIMERANGE_END))); 55 } 56 57 if (conf.get(SCAN_MAXVERSIONS) != null) { 58 scan.setMaxVersions(Integer.parseInt(conf.get(SCAN_MAXVERSIONS))); 59 } 60 61 if (conf.get(SCAN_CACHEDROWS) != null) { 62 scan.setCaching(Integer.parseInt(conf.get(SCAN_CACHEDROWS))); 63 } 64 65 // false by default, full table scans generate too much BC churn 66 scan.setCacheBlocks((conf.getBoolean(SCAN_CACHEBLOCKS, false))); 67 } catch (Exception e) { 68 LOG.error(StringUtils.stringifyException(e)); 69 } 70 } 71 72 setScan(scan); 73 }
首先会通过配置信息获取HBase表名,然后构造一个HTable对象;如果用户自己的作业中有配置Scan的话,就会解码Scan字符串转换为Scan对象;如果用户没配置Scan就会创建一个默认的Scan,进行一些基本配置。
关于TableInputFormatBase,我们重点还是讲两个方法:RecordReader<ImmutableBytesWritable, Result> createRecordReader(InputSplit split, TaskAttemptContext context)方法和List<InputSplit> getSplits(JobContext context)方法,前者是读取分片信息所指的数据供TableMapper处理,后者是构造HBase表的分片信息。这里的分片信息是TableSplit extends InputSplit implements Writable, Comparable,这个TableSpli维护4个字段,HBase表名:byte [] tableName、scan起始rowkey:byte [] startRow、scan结束rowkey:byte [] endRow、以及该region所在节点:String regionLocation。
一、先看getSplits方法吧,这里一个split一般对应一个完整region,除非用户设定的开始和结束rowkey不是region的边界,代码如下:
1 /** 2 * Calculates the splits that will serve as input for the map tasks. The 3 * number of splits matches the number of regions in a table. 4 * 5 * @param context The current job context. 6 * @return The list of input splits. 7 * @throws IOException When creating the list of splits fails. 8 * @see org.apache.hadoop.mapreduce.InputFormat#getSplits( 9 * org.apache.hadoop.mapreduce.JobContext) 10 */ 11 @Override 12 public List<InputSplit> getSplits(JobContext context) throws IOException { 13 if (table == null) { 14 throw new IOException("No table was provided."); 15 } 16 // Get the name server address and the default value is null. 17 this.nameServer = 18 context.getConfiguration().get("hbase.nameserver.address", null); 19 20 Pair<byte[][], byte[][]> keys = table.getStartEndKeys();//获取所有Region的开始rowkey和结束rowkey 21 if (keys == null || keys.getFirst() == null || 22 keys.getFirst().length == 0) { // 23 //table的第一个region的startKey必须是EMPTY_BYTE_ARRAY,否则输出FIRST_REGION_STARTKEY_NOT_EMPTY信息 24 HRegionLocation regLoc = table.getRegionLocation( 25 HConstants.EMPTY_BYTE_ARRAY, false); 26 if (null == regLoc) { //一个region也没有 27 throw new IOException("Expecting at least one region."); 28 } 29 List<InputSplit> splits = new ArrayList<InputSplit>(1); 30 //构造一个TableSplit,起始rowkey和结束rowkey都是EMPTY_BYTE_ARRAY 31 InputSplit split = new TableSplit(table.getTableName(), 32 HConstants.EMPTY_BYTE_ARRAY, HConstants.EMPTY_BYTE_ARRAY, regLoc 33 .getHostnamePort().split(Addressing.HOSTNAME_PORT_SEPARATOR)[0]); 34 splits.add(split); 35 return splits; //返回分片信息 36 } 37 List<InputSplit> splits = new ArrayList<InputSplit>(keys.getFirst().length); 38 for (int i = 0; i < keys.getFirst().length; i++) { //有多个region 39 if ( !includeRegionInSplit(keys.getFirst()[i], keys.getSecond()[i])) { //这个方法一直返回true 40 continue; 41 } 42 HServerAddress regionServerAddress = 43 table.getRegionLocation(keys.getFirst()[i]).getServerAddress(); 44 InetAddress regionAddress = 45 regionServerAddress.getInetSocketAddress().getAddress();//获取region所在地址 46 String regionLocation; 47 try { 48 regionLocation = reverseDNS(regionAddress);//将地址转换为字符串的主机名 49 } catch (NamingException e) { 50 LOG.error("Cannot resolve the host name for " + regionAddress + 51 " because of " + e); 52 regionLocation = regionServerAddress.getHostname(); 53 } 54 55 byte[] startRow = scan.getStartRow(); //获取scan的开始rowkey 56 byte[] stopRow = scan.getStopRow(); //获取scan的结束rowkey 57 // determine if the given start an stop key fall into the region 58 //比较用户设定的rowkey范围在那些region之中 59 if ((startRow.length == 0 || keys.getSecond()[i].length == 0 || 60 Bytes.compareTo(startRow, keys.getSecond()[i]) < 0) && 61 (stopRow.length == 0 || 62 Bytes.compareTo(stopRow, keys.getFirst()[i]) > 0)) { 63 byte[] splitStart = startRow.length == 0 || 64 Bytes.compareTo(keys.getFirst()[i], startRow) >= 0 ? 65 keys.getFirst()[i] : startRow; 66 byte[] splitStop = (stopRow.length == 0 || 67 Bytes.compareTo(keys.getSecond()[i], stopRow) <= 0) && 68 keys.getSecond()[i].length > 0 ? 69 keys.getSecond()[i] : stopRow; 70 InputSplit split = new TableSplit(table.getTableName(), 71 splitStart, splitStop, regionLocation); //构造TableSplit 72 splits.add(split); 73 if (LOG.isDebugEnabled()) { 74 LOG.debug("getSplits: split -> " + i + " -> " + split); 75 } 76 } 77 } 78 return splits; 79 }
Pair这个结构由两部分组成:start和end,都是byte[][],这是一个二维byte数组,其中一维是region的顺序,二维是start或者end的字符序列。通过getFirst方法就可以获取所有region的start rowkey,通过getSecond可以获得所有的end rowkey。
这里还有一个要注意的就是每个HBase表的第一个region是没有start rowkey,最后一个region是没有end rowkey,这里的“没有”是指的是table.getStartEndKeys()这个方法获取的结果,另外大伙也可以从WEB UI中查看指定的HBase表的region信息也可以看到第一个region的start和最后一个region的end并没有显示。还有就是如果这个HBase表只有一个region的话,getFirst方法返回是没有数据的;getSecond也没数据。
(1)、getSplits方法中的第一个if语句段是上面说的只有一个region的情况。每个HBase表的第一个region的start rowkey都是EMPTY_BYTE_ARRAY,这是一个长度为0的byte数组。table.getRegionLocation方法会找指定的rowkey所在的region所在信息HRegionLocation。如果只有一个region的话,就先找EMPTY_BYTE_ARRAY所在region信息,如果没有这样的信息就是出现了错误;如果如果有这样的信息的话,就构建一个长度为1的InputSplit列表splits,构造一个TableSplit:设定HBase表名,scan起始和结束rowkey都是EMPTY_BYTE_ARRAY,再加上region所在节点,把这个TableSplit加入splits,返回这个splits。
(2)、接下来就是HBase表有多个region的情况,构建长度为keys.getFirst().length的InputSplit列表,然后遍历keys.getFirst()获取每个region的位置信息并将其转换成String类型(reverseDNS方法从reverseDNSCacheMap中获取,reverseDNSCacheMap是存储IPAddress => HostName的映射);然后获取用户设定的起始和结束rowkey,并和当前的region的起始和比较结束,如果有rowkey包含这个region就会将这region当做一个InputSplit放入列表中,最后待遍历完之后返回split列表。判断当前region是否应该加入InputSplit列表的条件就是循环中的最后一个if语句段,条件是:((startRow.length == 0 || keys.getSecond()[i].length == 0 ||Bytes.compareTo (startRow, keys.getSecond()[i]) < 0) && (stopRow.length == 0 || Bytes.compareTo(stopRow, keys.getFirst()[i]) > 0)),分解这个条件为两部分:A、(startRow.length == 0 || keys.getSecond()[i].length == 0 ||Bytes.compareTo (startRow, keys.getSecond()[i]) < 0)这个是要确定用户设定的start rowkey是否小于当前region的结束rowkey;B、(stopRow.length == 0 || Bytes.compareTo(stopRow, keys.getFirst()[i]) > 0)这个是要确定用户设定的end rowkey是否大于当前region的开始rowkey,这俩条件必须同时满足才可以,一旦满足就要确定这个TableSplit的开始rowkey和结束rowkey了:A、startRow.length == 0 || Bytes.compareTo(keys.getFirst()[i], startRow) >= 0如果为true的话,说明用户设定的起始rowkey可能是从表的开头开始或者是当前region的起始rowkey大于用户设定的则应该将当前region的起始rowkey作为TableSplit的起始rowkey,如果表达式为false的话将用户设定的起始rowkey作为TableSplit的起始rowkey;B、(stopRow.length == 0 || Bytes.compareTo(keys.getSecond()[i], stopRow) <= 0) && keys.getSecond()[i].length > 0如果为true的话,说明首先要确定是否设定的结束rowkey或者当前region的结束rowkey小于用户设定的结束rowkey,且要保证当前region不是最后一个(keys.getSecond()[i].length > 0),这样的的TableSplit的结束rowkey就是当前region的结束rowkey,如果为false则将用户设定的结束rowkey为TableSplit的结束rowkey,为什么要不是最后一个region呢?因为最后一个region的end rowkey的长度始终为0,比较之下会将最后一个region的end rowkey设置给TableSplit,显然这是不对,能到这里说明这个region应该被分配给一个TableSplit,如果是最后一个region的话,那么这个TableSplit的结束rowkey应该是用户设定的而非这个region自己的。获得这个tableSplit的开始和结束rowkey之后就可以封装这个TableSplit了,并放入InputSplit列表。最终待所有的region遍历结束之后返回这个InputSplit列表。
这样getSplits方法就结束了。
二、createRecordReader方法,这个方法代码如下:
1 /** 2 * Builds a TableRecordReader. If no TableRecordReader was provided, uses 3 * the default. 4 * 5 * @param split The split to work with. 6 * @param context The current context. 7 * @return The newly created record reader. 8 * @throws IOException When creating the reader fails. 9 * @see org.apache.hadoop.mapreduce.InputFormat#createRecordReader( 10 * org.apache.hadoop.mapreduce.InputSplit, 11 * org.apache.hadoop.mapreduce.TaskAttemptContext) 12 */ 13 @Override 14 public RecordReader<ImmutableBytesWritable, Result> createRecordReader( 15 InputSplit split, TaskAttemptContext context) 16 throws IOException { 17 if (table == null) { 18 throw new IOException("Cannot create a record reader because of a" + 19 " previous error. Please look at the previous logs lines from" + 20 " the task's full log for more details."); 21 } 22 TableSplit tSplit = (TableSplit) split; 23 TableRecordReader trr = this.tableRecordReader; 24 // if no table record reader was provided use default 25 if (trr == null) { 26 trr = new TableRecordReader(); 27 } 28 Scan sc = new Scan(this.scan); 29 sc.setStartRow(tSplit.getStartRow()); 30 sc.setStopRow(tSplit.getEndRow()); 31 trr.setScan(sc); 32 trr.setHTable(table); 33 try { 34 trr.initialize(tSplit, context); 35 } catch (InterruptedException e) { 36 throw new InterruptedIOException(e.getMessage()); 37 } 38 return trr; 39 }
这个方法主要是获取TableSplit,然后构造一个Scan,设定开始和结束rowkey;设定HTablePool;将Scan和HTable传递给一个TableRecordReader对象,然后调用initialize(tSplit, context)初始化,最后返回这个TableRecordReader。可以看出TableRecordReader这个是读取key/value的。TableRecordReader中实际操作数据的是TableRecordReaderImpl,TableRecordReader的nextKeyValue()、getCurrentValue()、initialize、getCurrentKey()方法会调用TableRecordReaderImpl的相应方法。
TableRecordReaderImpl的initialize方法主要是重新创建一个新的Scan,并将createRecordReader传过来的赋值给这个新的currentScan,并获取对应的ResultScanner。
TableRecordReaderImpl的nextKeyValue()会先创建一个key = new ImmutableBytesWritable()和value = new Result(),这就是我们继承TableMapper中map方法中的参数类型,然后每次调用该方法通过执行value = this.scanner.next()方法来获取HBase中的一行数据赋值给value,这里表明如果scanner.next()运行无异常的话key中是没有数据的(出现异常之后会存储value对应行的rowkey),只有value有数据。执行了这个方法就可以通过getCurrentValue()、getCurrentKey()方法来获取value和key了。
上面这些讲解了在HBase上使用MapReduce时的分片过程及如何读取这些分片上的数据的。