[seaborn] seaborn学习笔记1-箱形图Boxplot
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1 箱形图Boxplot
(代码下载)
Boxplot可能是最常见的图形类型之一。它能够很好表示数据中的分布规律。箱型图方框的末尾显示了上下四分位数。极线显示最高和最低值,不包括异常值。seaborn中用boxplot函数制作箱形图。该章节主要内容有:
- 基础箱形图绘制 Basic boxplot and input format
- 自定义外观 Custom boxplot appearance
- 箱型图的颜色设置 Control colors of boxplot
- 分组箱图 Grouped Boxplot
- 箱图的顺序设置 Control order of boxplot
- 添加散点分布 Add jitter over boxplot
- 显示各类的样本数 Show number of observation on boxplot
- 箱形图隐藏的数据处理 Hidden data under boxplot
#调用seaborn
import seaborn as sns
#调用seaborn自带数据集
df = sns.load_dataset('iris')
#显示数据集
df.head()
sepal_length | sepal_width | petal_length | petal_width | species | |
---|---|---|---|---|---|
0 | 5.1 | 3.5 | 1.4 | 0.2 | setosa |
1 | 4.9 | 3.0 | 1.4 | 0.2 | setosa |
2 | 4.7 | 3.2 | 1.3 | 0.2 | setosa |
3 | 4.6 | 3.1 | 1.5 | 0.2 | setosa |
4 | 5.0 | 3.6 | 1.4 | 0.2 | setosa |
1. 基础箱形图绘制 Basic boxplot and input format
- 一个数值变量 One numerical variable only
- 一个数值变量和多个分组 One numerical variable, and several groups
- 多个数值变量 Several numerical variable
- 水平箱型图 Horizontal boxplot with seaborn
# 一个数值变量 One numerical variable only
# 如果您只有一个数字变量,则可以使用此代码获得仅包含一个组的箱线图。
# Make boxplot for one group only
# 显示花萼长度sepal_length
sns.boxplot( y=df["sepal_length"] );
# 一个数值变量和多个分组 One numerical variable, and several groups
# 假设我们想要研究数值变量的分布,但是对于每个组分别进行研究。在这里,我们研究了3种花的萼片长度。
# x花的品种,y花萼长度
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"] );
# 多个数值变量 Several numerical variable
# 可以研究几个数值变量的分布,比如说萼片的长度和宽度:
sns.boxplot(data=df.iloc[:,0:2]);
# 水平箱型图 Horizontal boxplot with seaborn
# 用seaborn将你的箱图水平转动是非常简单的。您可以切换x和y属性,或使用选项orient ="h"
sns.boxplot( y=df["species"], x=df["sepal_length"] );
2. 自定义外观 Custom boxplot appearance
- 自定义线宽 Custom line width
- 添加缺口 Add notch
- 控制箱的尺寸 Control box sizes
# 自定义线宽 Custom line width
# Change line width
# 根据linewidth改变线条宽度
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"], linewidth=5);
# 添加缺口 Add notch
# notch设置为true即可
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"], notch=True);
# 控制箱的尺寸 Control box sizes
# Change width
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"], width=0.3);
3. 箱型图的颜色设置 Control colors of boxplot
- 调色板的使用 Use a color palette
- 单种颜色的使用 Uniform color
- 每组的特定颜色 Specific color for each group
- 单组高亮 Highlight a group
- 添加透明色 Add transparency to color
# 调色板的使用 Use a color palette
# Python提出了几种调色板。您可以像Set1,Set2,Set3,Paired,BuPu一样调用RColorBrewer调色板,还有Blues或BuGn_r等调色板。
# 调色板各种颜色见 http://www.r-graph-gallery.com/38-rcolorbrewers-palettes/
# t通过plaette调用调色板,Use a color palette
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"], palette="Blues");
# 单种颜色的使用 Uniform color
# 当然您可以轻松地为每个盒子应用同样的颜色。最常见的是b: blue
# 颜色列表 https://matplotlib.org/examples/color/named_colors.html
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"], color="skyblue");
# 每组的特定颜色 Specific color for each group
# 用不用颜色描绘不同种类的花
my_pal = {"versicolor": "g", "setosa": "b", "virginica":"m"}
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"], palette=my_pal);
# 单组高亮 Highlight a group
# 设定某一组为红色,其他组为蓝色
my_pal = {species: "r" if species == "versicolor" else "b" for species in df.species.unique()}
sns.boxplot( x=df["species"], y=df["sepal_length"], palette=my_pal);
# 添加透明色 Add transparency to color
# usual boxplot 正常绘图
ax = sns.boxplot(x='species', y='sepal_length', data=df);
# Add transparency to colors 设置透明色
for patch in ax.artists:
r, g, b, a = patch.get_facecolor()
patch.set_facecolor((r, g, b, .3))
4. 分组箱图 Grouped Boxplot
# 当您有一个数值变量,几个组和子组时,将使用分组箱图。使用seaborn很容易实现。Y是您的数字变量,x是组列,而hue是子组列。
# 调用tips数据集
df_tips = sns.load_dataset('tips')
df_tips.head()
total_bill | tip | sex | smoker | day | time | size | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 16.99 | 1.01 | Female | No | Sun | Dinner | 2 |
1 | 10.34 | 1.66 | Male | No | Sun | Dinner | 3 |
2 | 21.01 | 3.50 | Male | No | Sun | Dinner | 3 |
3 | 23.68 | 3.31 | Male | No | Sun | Dinner | 2 |
4 | 24.59 | 3.61 | Female | No | Sun | Dinner | 4 |
# Grouped boxplot 分组箱图
# x日期,y餐费,hue自组列,palette调色盘
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", hue="smoker", data=df_tips, palette="Set1");
5. 箱图的顺序设置 Control order of boxplot
#如果您按特定顺序设定组,则箱图通常会提供更多信息。这对seaborn来说是可行的。
# specific order 通过order自定义组
p1=sns.boxplot(x='species', y='sepal_length', data=df, order=["virginica", "versicolor", "setosa"]);
# 中位数由大到小排列
# Find the order 设定中位数
my_order = df.groupby(by=["species"])["sepal_length"].median().iloc[::-1].index
# Give it to the boxplot
sns.boxplot(x='species', y='sepal_length', data=df, order=my_order);
6. 添加散点分布 Add jitter over boxplot
# 可以在箱线图上添加每种类别的散点分布情况
# Usual boxplot 正常绘图
ax = sns.boxplot(x='species', y='sepal_length', data=df)
# Add jitter with the swarmplot function 添加散点分布
ax = sns.swarmplot(x='species', y='sepal_length', data=df, color="grey")
7. 显示各类的样本数 Show number of observation on boxplot
# 显示每个组的观察次数可能很有用
# 基础的箱形图
ax = sns.boxplot(x="species", y="sepal_length", data=df)
# Calculate number of obs per group & median to position labels
# 计算各个种类的中位数
medians = df.groupby(['species'])['sepal_length'].median().values
# 统计各个种类的样本数
nobs = df['species'].value_counts().values
nobs = [str(x) for x in nobs.tolist()]
nobs = ["n: " + i for i in nobs]
# Add it to the plot
pos = range(len(nobs))
for tick,label in zip(pos,ax.get_xticklabels()):
ax.text(pos[tick], medians[tick] + 0.03, nobs[tick], horizontalalignment='center', size='x-small', color='w', weight='semibold')
8. 箱形图隐藏的数据处理 Hidden data under boxplot
- 添加分布散点图 boxplot with jitter
- 使用小提琴图 use violinplot
箱形图总结了几个组的数值变量的分布。但是箱形图的问题不仅是丢失信息,这可能会结果有偏差。如果我们考虑下面的箱形图,很容易得出结论,'C’组的价值高于其他组。但是,我们无法看到每个组中点的基本分布是什么,也没有观察每个组的观察次数。所以我们需要对隐藏的数据进行处理
# libraries and data
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# Dataset:
a = pd.DataFrame({ 'group' : np.repeat('A',500), 'value': np.random.normal(10, 5, 500) })
b = pd.DataFrame({ 'group' : np.repeat('B',500), 'value': np.random.normal(13, 1.2, 500) })
c = pd.DataFrame({ 'group' : np.repeat('B',500), 'value': np.random.normal(18, 1.2, 500) })
d = pd.DataFrame({ 'group' : np.repeat('C',20), 'value': np.random.normal(25, 4, 20) })
e = pd.DataFrame({ 'group' : np.repeat('D',100), 'value': np.random.uniform(12, size=100) })
df=a.append(b).append(c).append(d).append(e)
# Usual boxplot
sns.boxplot(x='group', y='value', data=df);
# 添加分布散点图 boxplot with jitter
ax = sns.boxplot(x='group', y='value', data=df)
# 通过stripplot添加分布散点图,jitter设置数据间距
ax = sns.stripplot(x='group', y='value', data=df, color="orange", jitter=0.2, size=2.5)
plt.title("Boxplot with jitter", loc="left")
Text(0.0, 1.0, 'Boxplot with jitter')
# 使用小提琴图 use violinplot
sns.violinplot( x='group', y='value', data=df)
plt.title("Violin plot", loc="left")
Text(0.0, 1.0, 'Violin plot')
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