nccmp - 比较netcdf的文件内容 - 编译安装
1. 简介
Compares two NetCDF files in-place to find specific variables, dimensions and/or attributes that differ. Highly recommended for any test-driven environment and regression testing large datasets.
2. 安装环境说明
天河二号，完整安装。
3. 相关软件下载
Hdf5: http://www.hdfgroup.org/HDF5/release/obtainsrc.html#conf
Netcdf-4.3.3: http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/ftp/netcdf-4.3.3.1.tar.gz
Nccmp-1.8.2: http://prdownloads.sourceforge.net/nccmp/nccmp-1.8.2.0.tar.gz
4. 软件编译安装
4.1）编译安装-hdf5
./configure –prefix= /HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/hdf5_install
Make –j12
Make install
4.2）编译安装-netcdf-4.3.3
4.2.1）首先设置hdf5相关变量（netcdf4.3所需）
HDF=/HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/hdf5_install
export CFLAGS="-I$HDF/include "
export LDFLAGS="-L$HDF/lib "
4.2.2）编译安装netcdf-4.3.3
./configure prefix=HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/netcdf_4.3.3_install
Make –j12
Make install
4.3）编译安装-nccmp
4.3.1）设置NC（netcdf相关目录）以及相关变量
NC=HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/netcdf_4.3.3_install
export CFLAGS="-I$HDF/include -I$NC/include"
export LDFLAGS="-L$HDF/lib -L$NC/lib"
4.3.2）编译安装nccmp：
./configure –prefix=/HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/nccmp_install –with-netcdf=/HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/netcdf-4.3.3.1/
注：/HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/netcdf-4.3.3.1/目录不是netcdf安装目录，而是源码包直接解压的目录。
Make –j12
Make install
4.4）设置环境变量
1 ##~/.bashrc 2 export LD_LIBRARY_PATH=/HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/netcdf_4.3.3_install/lib:$LD_LIBRARY_PATH 3 export PATH=/HOME/nsfc2015_567/NSFC/netcdf_comp_test/nccmp_install/bin:$PATH
5. 测试(海浪波软件exp1案例)
nccmp -dF -v hs -r 0.01 pac_ncep_wav_20090102.nc ./test/pac_ncep_wav_20090102.nc
部分参数说明：
-d：表示比较变量的value（值）
-F：表示与fortran相关
-t：表示absolute difference
-v：指定比较变量，多个变量用逗号分隔开，如 -v windy,windx
-f：不要比较一次就退出（比较出所有的差异值）
-n：多线程比较，可用于加速，如-n 4
其他功能，请参照nccmp --help.
