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3ds Max 阅读全文
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1] gmx插入分子[ -f [<.gro / .g96 / ...>] ] [ -ci [<.gro / .g96 / ...>] ] [ -ip [<.dat>] ] [ - n [<.ndx>] ] [ -o [<.gro / .g96 / ...>] ] [ -replace <选择> ] 阅读全文
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1. GMX grompp 概要 gmx grompp [ -f [<.mdp>] ] [ -c [<.gro / .g96 / ...>] ] [ -r [<.gro / .g96 / ...>] ] [ -rb [<.gro / .g96 / ...>] ] [ -n [<.ndx>] ] [ 阅读全文
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First]前处理 Second]运行MD Third]后处理 一、获得结构文件-来自实验数据或者某些化学软件工具 1】第一步: 获取并处理pdb文件 从Protein Data Bank下载小肽的pdb文件1OMB.PDB(或点击这里下载). 在Linux下你可使用如下命令: wget http: 阅读全文
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一、概念 二、安装 三、实例运行 nohup:即 no hang up，使执行的指令在SSH链接断开后也能继续运行； &：使执行的指令后台运行； 搭配使用：当执行的指令运行时间太长时，搭配使用，即 nohup YourCommandHere & 阅读全文
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一、背景 氨（NH 3）是一种新兴的能量载体，在液氨中含有17.6％（重量）的氢，而在甲醇中的含量为12.5％（重量），很可能成为未来氢能经济的有希望的候选者。然而，如果基于NH 3的肥料不足以养活世界上快速增长的人口，那么进一步的发展将是不可能的。不断增加的氨需求刺激了上个世纪人工NH 3大规模生 阅读全文
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一、Linux 查看机器的cpu，操作系统等命令 [root@f3 ~]# head -n 1 /etc/issue CentOS release 6.4 (Final) 二、Linux文件系统 1.Ubuntu 查看磁盘空间大小命令 df -h Df命令是linux系统以磁盘分区为单位查看文件系统 阅读全文
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嵌锂化学势定义为：EV=−(ET−E0−nELi)/ne，其中e是电子电荷，ELi是Li体相中一个Li原子的能量，E0是所研究体系的能量，ET是n个Li原子吸附的相应体系的能量。 阅读全文
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一、C=nF/3.6M （mAh/g） 二、活性物质的理论容量=26.8*反应中价态变化数/活性物质的分子量（Ah/g） 三、理论容量：1mol电子电量为96485C，假设材料发生的是n个电子的电化学反应，1mol活性物质发生电化学反应产生的电量则为96485n C=96485n A*s，所以单位质 阅读全文
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原文链接：http://blog.sciencenet.cn/blog-478347-374981.html 一、概述 vasp用“slab” 模型来模拟表面体系结构。 vasp计算表面的大概步骤是： 材料体性质的计算；表面模型的构造；表面结构的优化；表面性质的计算。二、分步介绍 1、材料体性质计算 阅读全文