【学习】Linux中的Pseudotime analysis

1. Monocle2

https://www.jianshu.com/p/5d6fd4561bc0

 

2. Cytotrace

iCytotrace的使用需要配置python环境

https://blog.csdn.net/weixin_41368414/article/details/126928866

conda create -n envname rbase=4.3.1 python=3.10

 

 然后python 中 pip install scanoramaCT包

• scanoramaCT 需要fix bug

 

设置R环境

在.Renviron中设置 library path

 下载R包的时候遇到了环境配置的问题  （环境配置真的很烦）

conda install glibc=2.39