摘要: GTF文件的全称是gene transfer format,主要是对染色体上的基因进行标注。怎么理解呢,其实所谓的基因名,基因座等,都只是后来人们给一段DNA序列起的名字而已,还原到细胞中就是细胞核里面的一条长长的染色体(DNA序列)。而这个GTF文件的主要功能,就是指出我们所谓的基因在染色体上的位 阅读全文
posted @ 2018-02-02 11:14 ly_godc 阅读(832) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 软件下载地址:可下载地址:https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2 soapdenovo组装可以一步跑完,也可分四步跑完,但是一般还是选择比较简单的一步: 一步跑完的脚本: ./SOAPdenovo all -s config_file -K 25 -R 阅读全文
posted @ 2018-01-25 09:51 ly_godc 阅读(2153) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一 概要 在了解Python的数据结构时,容器(container)、可迭代对象(iterable)、迭代器(iterator)、生成器(generator)、列表/集合/字典推导式(list,set,dict comprehension)众多概念参杂在一起,难免让初学者一头雾水,我将用一篇文章试图 阅读全文
posted @ 2018-01-12 14:35 ly_godc 阅读(272) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本节内容 github介绍 安装 仓库创建& 提交代码 代码回滚 工作区和暂存区 撤销修改 删除操作 远程仓库 分支管理 多人协作 github使用 忽略特殊文件.gitignore 为什么要用版本控制? 假设你在的公司要上线一个新功能,你们开发团队为实现这个新功能,写了大约5000行代码,上线没2 阅读全文
posted @ 2018-01-08 13:13 ly_godc 阅读(345) 评论(2) 推荐(0) 编辑
摘要: 本人用的服务器是在阿里上租的ECS,系统为centos7.2。看了一下,用yum安装比较方便,索性就使用它来安装。 下载新repo 到/etc/yum.repos.d/wget -O /etc/yum.repos.d/epel.repo http://mirrors.aliyun.com/repo/ 阅读全文
posted @ 2017-07-10 15:08 ly_godc 阅读(958) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 二进制 一个字节等于8个二进制数 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 128 64 32 16 8 4 2 1 1代表有,0代表没有,从右往左看,八个二进制数分别代表了1,2,4,8,16,32,64,128。这8个二进制组合可以代表1~256当中的任何一个数字(所有都是 阅读全文
posted @ 2016-10-23 10:39 ly_godc 阅读(6703) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 我们在学习python类的时候,总会碰见书上的类中有__init__()这样一个函数,很多同学百思不得其解,其实它就是python的构造方法。 构造方法类似于类似init()这种初始化方法,来初始化新创建对象的状态,在一个对象呗创建以后会立即调用,比如像实例化一个类: 使用构造方法就能让它简化成如下 阅读全文
posted @ 2016-10-05 10:23 ly_godc 阅读(54970) 评论(2) 推荐(4) 编辑
摘要: 一、可以通过代码或者图形用户界面保存图形,绘图语句夹在开启目标图形设备语句和关闭图形设备的语句之间; 二、图形参数: 1、通过par()指定参数选项,这种方式设定的参数值除非被再次修改,否则会在绘画结束前一直有效,添加参数no.readonly=TRUE可以生成一个可以修改的当前图形列表参数; 2、 阅读全文
posted @ 2016-07-31 10:54 ly_godc 阅读(1450) 评论(0) 推荐(1) 编辑