管道工人刘亚军的技术基地

摘要： 配置环境变量是指为了让系统或程序识别并访问一些特定的路径、库文件或命令等，而将这些路径、库文件或命令等信息保存在系统环境变量中，以便系统或程序使用。环境变量是一种存储在操作系统中的全局变量，它可以为程序提供一个特定的工作环境和配置信息。 在Linux操作系统中，可以通过编辑.bashrc文件来添加环 阅读全文

摘要： 将CSV文件转换为H5AD文件，可以按照以下步骤进行： 使用pandas库将CSV文件读入到Python中，并将其转换为dataframe格式： import pandas as pd df = pd.read_csv('data.csv') 使用anndata库将dataframe转换为AnnDa 阅读全文

摘要： 要查看 GPU 使用情况，您可以根据您的操作系统使用以下命令行代码： 对于 NVIDIA 显卡： 使用 nvidia-smi 命令来查看 GPU 的使用情况。在命令行中输入以下命令： nvidia-smi 这将显示当前 NVIDIA GPU 的状态，包括温度、功率、显存使用情况以及正在运行的进程等信 阅读全文

摘要： 在介绍Python常见的数据结构之前，需要注意以下几点： 数据结构是编程中的基础，不同的数据结构适用于不同的场景，选择合适的数据结构可以提高程序的效率和可读性。 Python有很多内置的数据结构，如列表、元组、集合和字典等，同时也可以通过第三方库扩展更多的数据结构。 在选择数据结构时，需要考虑数据的 阅读全文

摘要： 在 Visual Studio Code (VS Code) 中，可以使用快捷键或菜单栏的选项来将一段代码注释掉。以下是两种方法： 方法一：使用快捷键 选中你想要注释的代码。 使用下列快捷键： Windows/Linux 用户：按下 Ctrl + /（单行注释）或 Ctrl + Shift + /（ 阅读全文

摘要： 生物医学信息学是一个跨学科领域，它结合了生物学、医学、信息学、计算机科学等多个学科的知识和技术。生物医学信息学的重要性主要体现在以下几个方面： 1.2.1 提高研究效率 生物医学信息学的方法和技术可以帮助研究人员更快速、更准确地分析和解释大量生物医学数据，从而提高研究效率。例如，基因组学中的基因预测 阅读全文

摘要： 摘要：随着单细胞测序技术的快速发展，越来越多的研究者开始关注单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹的推断。本综述旨在介绍单细胞RNA-seq数据分析中细胞发育轨迹推断的进展，并重点介绍该领域常用的软件包，以期对相关研究者提供帮助。 引言 单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术为研究细胞间的异质性 阅读全文

摘要： AnnData是一个用于单细胞数据分析的Python类，由Scanpy团队开发。它主要用于存储和处理单细胞RNA-seq数据，并提供了丰富的功能和方法来进行数据预处理、分析和可视化。 AnnData对象中存储的是基因表达矩阵（Gene Expression Matrix）及其相关的注释信息，例如细胞 阅读全文

摘要： 摘要：随着单细胞测序技术的发展，生物信息学在单细胞数据分析方面取得了重要进展。本文将为生物和医学科研工作者介绍单细胞转录组测序数据生物信息分析的进展，重点介绍该领域的最新研究成果和常用软件包。 引言 单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术已经成为研究细胞异质性和功能的重要手段。为了从海量的单细胞 阅读全文

摘要： 摘要：单细胞转录组学是一种基于高通量测序技术的单细胞基因表达研究方法。近年来，随着测序技术的快速发展，单细胞转录组学已成为生物医学领域的重要研究手段。本文将介绍单细胞转录组学的基本原理、技术发展、应用以及存在的挑战。 引言 在传统转录组学研究中，研究者通常使用大量细胞的平均基因表达数据。然而，这种方 阅读全文