文章分类 - 生物信息学
摘要:序列比对是生物信息学中的一种基本方法,主要用于比较两个或多个生物序列(如DNA、RNA或蛋白质序列)之间的相似性。序列比对可以帮助我们找到序列之间的同源关系、研究基因家族和进化,以及预测蛋白质结构和功能等。 序列比对 序列比对主要包括两种类型:局部比对和全局比对。局部比对关注序列中相似度最高的部分,
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摘要:生物医学数据预处理和数据质控是生物医学信息学研究的关键步骤,它们对于数据分析的准确性和可靠性具有重要意义。预处理是指对原始数据进行清洗、整理和转换,使其适合后续分析。数据质控则是评估数据质量,确保数据准确无误。 生物医学数据预处理 预处理过程包括以下几个方面: (1) 数据清洗:去除无关数据、重复数
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摘要:在生物医学领域,数据类型繁多,可以大致分为以下几类: 2.1 基因组数据 基因组数据是指包含生物体全部基因的遗传信息。这类数据主要来源于基因测序技术,如Sanger测序和高通量测序。基因组数据通常以FASTA、FASTQ等格式存储。例如,人类基因组计划(Human Genome Project)是一
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摘要:
摘要:随着单细胞测序技术的快速发展,越来越多的研究者开始关注单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹的推断。本综述旨在介绍单细胞RNA-seq数据分析中细胞发育轨迹推断的进展,并重点介绍该领域常用的软件包,以期对相关研究者提供帮助。 引言 单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术为研究细胞间的异质性
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摘要:
摘要:单细胞转录组学是一种基于高通量测序技术的单细胞基因表达研究方法。近年来,随着测序技术的快速发展,单细胞转录组学已成为生物医学领域的重要研究手段。本文将介绍单细胞转录组学的基本原理、技术发展、应用以及存在的挑战。 引言 在传统转录组学研究中,研究者通常使用大量细胞的平均基因表达数据。然而,这种方
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