随笔分类 -  生物信息学

摘要:基因芯片数据分析通常包括以下程序: 1. 数据预处理:对原始芯片数据进行质控、去噪和归一化处理,确保数据的准确性和可比性。 2. 差异表达分析:通过比较不同条件下的基因表达水平,找出在不同条件下显著差异表达的基因。 3. 功能富集分析:将差异表达的基因进行功能注释和分类,然后使用统计方法判断哪些功能 阅读全文
posted @ 2023-09-06 17:28 管道工人刘博 阅读(226) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:元数据(Metadata)是描述数据的数据,它提供了关于数据的详细信息,例如数据的结构、内容、属性和关系等。元数据可以帮助人们理解和管理数据,以及对数据进行有效的组织、分类和搜索。 以下是有关元数据的一些重要概念: 1. 描述性元数据(Descriptive Metadata):描述性元数据提供了关 阅读全文
posted @ 2023-07-18 13:09 管道工人刘博 阅读(837) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:UPGMA(Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean)是一种常用的聚类分析方法,用于构建进化树或聚类树。它基于样本之间的相似性或距离矩阵,将样本逐步合并成群集,并计算新群集的平均距离。 UPGMA的基本原理是按照距离最小的原则,通过计算两个最 阅读全文
posted @ 2023-07-16 19:49 管道工人刘博 阅读(2159) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:VCF(Variant Call Format)文件是一种常用的存储基因组变异信息的文件格式。它是基于文本的格式,用于描述个体或种群的基因组中的单核苷酸变异(SNV)、插入/缺失(Indel)等变异类型。 以下是VCF文件的一般结构和主要字段: 1. 文件元数据(Metadata):以`##`开头的 阅读全文
posted @ 2023-07-01 20:51 管道工人刘博 阅读(3406) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:医学数字成像和通信(DICOM,Digital Imaging and Communications in Medicine)是一种广泛应用于医学影像领域的国际标准。DICOM定义了一套用于存储、传输、共享和打印医学影像数据的规范和协议,使得不同厂商生产的医学设备和软件之间可以相互兼容和交流。 DI 阅读全文
posted @ 2023-04-27 16:54 管道工人刘博 阅读(1077) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:生物医学信息学是一个跨学科领域,它结合了生物学、医学、信息学、计算机科学等多个学科的知识和技术。生物医学信息学的重要性主要体现在以下几个方面: 1.2.1 提高研究效率 生物医学信息学的方法和技术可以帮助研究人员更快速、更准确地分析和解释大量生物医学数据,从而提高研究效率。例如,基因组学中的基因预测 阅读全文
posted @ 2023-04-06 15:24 管道工人刘博 阅读(619) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:生物医学信息学的起源与发展生物医学信息学(Bioinformatics)是一门研究生物学信息的学科,它起源于20世纪50年代,随着分子生物学的发展,生物医学信息学逐渐成为一门独立的学科。它的发展历程可分为几个阶段: 早期阶段(20世纪50-60年代) 这一阶段的生物医学信息学主要集中在对生物学信息的收集、整理和分析。1953 阅读全文
posted @ 2023-04-05 11:11 管道工人刘博 阅读(882) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:摘要:转录组学是一门研究全套转录产物(包括 mRNA、非编码 RNA 和其他 RNA 类型)的科学,旨在揭示基因表达调控机制及其在生物过程和疾病中的功能。本文将对转录组学的发展历程、主要技术方法、研究领域以及面临的挑战进行概述,以期为生物和医学科研工作者提供一个全面的转录组学认识。 1.引言随着高通 阅读全文
posted @ 2023-04-01 19:47 管道工人刘博 阅读(631) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:生物信息学和医学信息学已经广泛应用于许多生命科学和医学领域。以下是一些重要的应用: 基因组学和转录组学:生物信息学在基因组学和转录组学方面的应用正在成为发现新基因、探索基因功能和预测疾病风险的关键工具。 药物研发:生物信息学在药物研发中的应用范围广泛,包括发现新药物靶标、评估候选药物的毒性和疗效、优 阅读全文
posted @ 2023-03-28 19:57 管道工人刘博 阅读(579) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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