摘要:
agp2assembly是juicebox_scripts之一。 功能:将agp文件转换为assembly文件。 官网:https://github.com/phasegenomics/juicebox_scripts 一、安装 cd ~/biosoft git clone https://gith 阅读全文
摘要:
官网:https://github.com/malonge/RagTag 一、简介 RagTag is a collection of software tools for scaffolding and improving modern genome assemblies. Tasks inclu 阅读全文
摘要:
官网:https://github.com/aidenlab/3d-dna 一、安装 3ddna和juicer共用同一个依赖环境,denpendency安装参见Juicer安装及使用 cd ~/biosoft git clone https://github.com/theaidenlab/3d-d 阅读全文
摘要:
bam2fastx,功能如其名,用于将Pacbio的bam文件转换为fastq/fasta格式。 官网:https://github.com/PacificBiosciences/bam2fastx 一、安装 conda create -n bam2fastx conda activate bam2 阅读全文
摘要:
参考自官网 https://github.com/aidenlab/juicer/wiki https://github.com/aidenlab/juicer 一、安装 #创建单独环境,安装依赖包。另外对java版本以及gawk版本有要求,一般服务器上都有(具体要求见官网)。 conda crea 阅读全文