摘要：
用得非常之多的一款组装软件。安装容易，使用简便，默认参数跑就完事。hifiasm 拼接快速，更好应对重复片段，产生组装集质量高。 基于Hi-C可以产生单倍型分辨率的组装集。 hifiasm组装后不需要polish，简化了组装流程，大大节省了时间。 一、安装 git clone https://git 阅读全文
摘要：
Quickmerge可以用于合并两个不同软件组装产生的Assemblies，以获取更可靠的组装结果。quickmerge 一、安装 git clone https://github.com/mahulchak/quickmerge.git cd quickmerge bash make_merger 阅读全文
摘要：
拼接部分采用默认参数。适用于ONT组装，对于PacBio数据有更优的软件处理，此处不讨论。 总的来说，拿到ONT的数据后，建议先尝试miniasm快速拼接看一下拼接情况，再决定使用什么策略进行精细的组装。这里列出了六种可用于ONT组装的软件的相关用法，另外还有FALCON可以尝试，看文献近两年好像使 阅读全文
摘要：
Graph-based从头拼接软件，和canu一样可以先correct然后再组装。但nextdenovo一般用于ont组装。结合nextpolish可以获取碱基准确度达985以上。 配置好组装序列文件路径以及配置文件，直接运行即可，使用简单。 Github官网 Tutorial 配置run.cfg说 阅读全文