Circos安装及使用

circos installation

一、安装

官网下载后解压即可使用

wget http://circos.ca/distribution/circos-0.69-6.tgz
tar xzf circos-0.69-6.tgz
cd circos-0.69
export PATH=$PATH:~/biosoft/circos-0.69/bin

可能会有perl模块缺失的问题,通过如下方式解决

#检查缺少模块
circos -module
#缺什么装什么,直到所有模块检测ok
sudo cpan -i Clone GD GD::Polyline List::Util Math::Bezier Math::BigFloat Math::Round Math::VecStat Params::Validate Readonly Set::IntSpan

二、测试

cd circos-0.69/example/
circos -conf etc/cicos.conf

运行成功后当前目录出图circos.pngcircos.svg,说明安装成功

若运行失败,再次检测缺少哪些perl模块,重新安装即可

 

posted @ 2022-10-27 23:25  pd_liu  阅读(380)  评论(0编辑  收藏  举报