Circos安装及使用
一、安装
官网下载后解压即可使用
wget http://circos.ca/distribution/circos-0.69-6.tgz
tar xzf circos-0.69-6.tgz
cd circos-0.69
export PATH=$PATH:~/biosoft/circos-0.69/bin
可能会有perl模块缺失的问题,通过如下方式解决
#检查缺少模块
circos -module
#缺什么装什么,直到所有模块检测ok
sudo cpan -i Clone GD GD::Polyline List::Util Math::Bezier Math::BigFloat Math::Round Math::VecStat Params::Validate Readonly Set::IntSpan
二、测试
cd circos-0.69/example/
circos -conf etc/cicos.conf
运行成功后当前目录出图circos.png
和circos.svg
,说明安装成功
若运行失败,再次检测缺少哪些perl模块,重新安装即可