RepeatMasker配置更新repbase数据库

RepBaseRepeatMaskerEdition-20181026版本（没有找到更新的版本，凑活用）

链接: https://pan.baidu.com/s/1rbXKWRTgk952t9KrPURDpQ 
提取码: 04k6

上传至服务器后解压，会产生一个Libraries目录包含有所需的重复序列文件

tar vxzf *.tar.gz

将Libraries下的内容拷贝至RepeatMasker中Libraries目录下

cp ~/repbase/Libraries/* ~/miniconda3/envs/EDTA/share/RepeatMasker/Libraries/

重新运行RepeatMasker的配置文件

cd ~/miniconda3/envs/EDTA/share/RepeatMasker
perl ./configure

随后按照提示配置完成即可，成功配置显示如下

日后如果是需要更新repbase只需要将对应旧的Libraries文件删除后，添加新的重新配置运行即可。不过官网提示更新的repbase版本似乎是序列的形式给出，因此是通过-lib参数调用的。估计是使用EDTA或者RepeatModeler构建文库过后，将repbase合并到一起使用的。